172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17951 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  819    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  69.62 
 
 
415 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  56.9 
 
 
577 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  48.93 
 
 
415 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  29.07 
 
 
357 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  22.58 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  25.54 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  22.25 
 
 
473 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.73 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  24.62 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.47 
 
 
551 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  21.47 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  21.93 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  25 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.12 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  21.93 
 
 
508 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  22.94 
 
 
869 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.88 
 
 
205 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
189 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  21.86 
 
 
948 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  23.9 
 
 
200 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  22.66 
 
 
920 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  18.66 
 
 
753 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  20.68 
 
 
915 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  19.53 
 
 
849 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  20.27 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.55 
 
 
940 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  22.37 
 
 
834 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  20.22 
 
 
931 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  24.09 
 
 
246 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  27 
 
 
191 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  28.26 
 
 
558 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 
921 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  28.26 
 
 
558 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  20.19 
 
 
828 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  31.11 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  20.39 
 
 
781 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  22.3 
 
 
191 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  20.19 
 
 
828 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  21.6 
 
 
910 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  22.33 
 
 
852 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  23.02 
 
 
191 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  23.32 
 
 
446 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  27.17 
 
 
558 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  20.06 
 
 
920 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  20 
 
 
947 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.67 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  23.32 
 
 
833 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  22.71 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
1055 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.67 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.67 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  20.06 
 
 
922 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.67 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.67 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  21.67 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  21.67 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  19.85 
 
 
919 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  32.84 
 
 
390 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  30.19 
 
 
243 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  36 
 
 
283 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.66 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  26.88 
 
 
552 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  20.54 
 
 
208 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  26.88 
 
 
552 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
376 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  24.47 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  24.68 
 
 
216 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  20.74 
 
 
936 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  26.88 
 
 
552 aa  49.7  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  32.84 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  20.5 
 
 
828 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.9 
 
 
186 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  23.39 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  20.44 
 
 
833 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  32.84 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  23.29 
 
 
185 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  22.17 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
187 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.53 
 
 
837 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.53 
 
 
837 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  23.68 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  21.43 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.53 
 
 
837 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  25.83 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  20.91 
 
 
912 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  25 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.03 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.49 
 
 
576 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.29 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  25.53 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  19.77 
 
 
212 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
977 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>