More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1183 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1183  aminotransferase class-III  100 
 
 		 466 aa  963    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.516791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1040  aminotransferase class-III  69.8 
 
 		 469 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503481  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0137  aminotransferase class-III  77.24 
 
 		 542 aa  736    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4333  4-aminobutyrate aminotransferase  76.5 
 
 		 457 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5524  4 animobutyrate aminotransferase  70.52 
 
 		 470 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0347  aminotransferase class-III  62.81 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0033  aminotransferase class-III  61.69 
 
 		 453 aa  597  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0794397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.8 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  32.27 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.34 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.21 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.33 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  32.95 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.08 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  31.74 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.82 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.62 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  31.59 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  31.04 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  30.05 
 
 		 396 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.26 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  30.22 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.84 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.91 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  30.57 
 
 		 963 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  30.4 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  30.23 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  30.29 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  29.3 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.65 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  30.68 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  30.91 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  31.62 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  30.04 
 
 		 958 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  31.11 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  31.11 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  29.65 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.1 
 
 		 470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.09 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  31.04 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  29.86 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  32.02 
 
 		 438 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.56 
 
 		 967 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  27.63 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  31.65 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  30.34 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.25 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  31.74 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.14 
 
 		 469 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  30.75 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  31.95 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  29.29 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  34.23 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  28.91 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  31.28 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  29.3 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  29.3 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  33.16 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  30.28 
 
 		 961 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.67 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  31.29 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  28.9 
 
 		 394 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  28.37 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  31.16 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  30.81 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  29.4 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  30.12 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  28.61 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.77 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  28.33 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 429 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.32 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.72 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.95 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  30.66 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>