More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0347 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0033  aminotransferase class-III  90.93 
 
 		 453 aa  866    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0794397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0347  aminotransferase class-III  100 
 
 		 453 aa  936    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1040  aminotransferase class-III  62.25 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503481  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1183  aminotransferase class-III  62.81 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.516791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0137  aminotransferase class-III  62.25 
 
 		 542 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4333  4-aminobutyrate aminotransferase  62.14 
 
 		 457 aa  594  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5524  4 animobutyrate aminotransferase  61.78 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.49 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.63 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  30.63 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.07 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  32.96 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  29.71 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.86 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.25 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  31.21 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  32.46 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.07 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  31.04 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  31.85 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  31.44 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  29.07 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  30.02 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  31.85 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  28.41 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  29.7 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  30.41 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  29.7 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  29.13 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  31.28 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 442 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  28.97 
 
 		 540 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  28.57 
 
 		 432 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  30.54 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.29 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  29.86 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.5 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  30.88 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.95 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  28.34 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  29.03 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  27.06 
 
 		 457 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.32 
 
 		 464 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  29.86 
 
 		 418 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  29.15 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.72 
 
 		 469 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  29.36 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.93 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.87 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  29.15 
 
 		 427 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  31.74 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  28.73 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.11 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  29.15 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  28.44 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  29.08 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  28.13 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.66 
 
 		 470 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.51 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  28.84 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28.21 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  29.67 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  28.21 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.6 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  30.21 
 
 		 474 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  28.27 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  28.77 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  28.33 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.02 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  28.81 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.16 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  28.17 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  27.36 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>