More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4333 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1183  aminotransferase class-III  76.5 
 
 		 466 aa  721    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.516791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5524  4 animobutyrate aminotransferase  71.3 
 
 		 470 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1040  aminotransferase class-III  69.82 
 
 		 469 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503481  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0137  aminotransferase class-III  93.63 
 
 		 542 aa  899    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4333  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 457 aa  952    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0347  aminotransferase class-III  62.14 
 
 		 453 aa  594  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0033  aminotransferase class-III  61.47 
 
 		 453 aa  587  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0794397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.72 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 		 479 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.78 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.58 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.26 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.26 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  32.05 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 		 420 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.25 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  30.86 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.57 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.87 
 
 		 461 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  30.97 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  32.04 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  31.22 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  30.24 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  30.18 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  31.29 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  29.41 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  28.35 
 
 		 442 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  30.02 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  29.26 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  28.98 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  29.84 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  29.82 
 
 		 427 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  29.45 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.3 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  28.85 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  29.12 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  29.45 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  29.45 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  30.44 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  29.78 
 
 		 467 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  29.45 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  30.11 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  30.92 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  29.89 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.67 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  28.96 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  30.35 
 
 		 963 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  28.88 
 
 		 396 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  28.88 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.71 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  27.98 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.54 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  30.95 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.43 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  29.66 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.57 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  29.74 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  30.31 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  28.12 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 		 426 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.88 
 
 		 958 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  28.95 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  28.4 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  28.88 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.3 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.2 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  28.4 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  29.91 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  29.27 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  28.88 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  28.88 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  28.88 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  30 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  29.77 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  29.51 
 
 		 430 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.24 
 
 		 469 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  28.64 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  27.88 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  27.75 
 
 		 540 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30.36 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>