More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0137 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0137  aminotransferase class-III  100 
 
 		 542 aa  1132    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1040  aminotransferase class-III  68.13 
 
 		 469 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503481  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4333  4-aminobutyrate aminotransferase  93.63 
 
 		 457 aa  899    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1183  aminotransferase class-III  77.24 
 
 		 466 aa  736    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.516791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5524  4 animobutyrate aminotransferase  71.33 
 
 		 470 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0347  aminotransferase class-III  62.25 
 
 		 453 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0033  aminotransferase class-III  61.37 
 
 		 453 aa  588  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0794397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.75 
 
 		 437 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.53 
 
 		 428 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.24 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 448 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.27 
 
 		 444 aa  208  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.61 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.8 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.21 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 454 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.21 
 
 		 454 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 468 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  31.11 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  31.31 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.54 
 
 		 461 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  31.94 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.33 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.05 
 
 		 454 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  31.44 
 
 		 420 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 		 430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  30.66 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  29.84 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  30.41 
 
 		 440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  30.77 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.33 
 
 		 459 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.07 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 429 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 429 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  29.08 
 
 		 446 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  29.95 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.34 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  29.79 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  28.67 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  30.67 
 
 		 467 aa  181  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  30.3 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.92 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  30.59 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.82 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  30.84 
 
 		 963 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  29.91 
 
 		 396 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.42 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  29.1 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.02 
 
 		 427 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  27.97 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  29.19 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.79 
 
 		 958 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  29.93 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  30.28 
 
 		 438 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  29.57 
 
 		 430 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  29.11 
 
 		 432 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  28.54 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  28.54 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  28.64 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  29.69 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  29.06 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  27.06 
 
 		 394 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  29.69 
 
 		 418 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  29.34 
 
 		 429 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.65 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.88 
 
 		 967 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  28.64 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  30.61 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  28.77 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  28.77 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  28.77 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  28.77 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  28.77 
 
 		 426 aa  170  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.58 
 
 		 460 aa  170  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  31.16 
 
 		 471 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  27.49 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  30 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  27.75 
 
 		 476 aa  169  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  29.73 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.79 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  27.07 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30.4 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.04 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>