More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5524 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1183  aminotransferase class-III  70.77 
 
 		 466 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.516791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1040  aminotransferase class-III  75.59 
 
 		 469 aa  739    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503481  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4333  4-aminobutyrate aminotransferase  71.3 
 
 		 457 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5524  4 animobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 470 aa  977    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0137  aminotransferase class-III  71.33 
 
 		 542 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0347  aminotransferase class-III  61.42 
 
 		 453 aa  597  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0033  aminotransferase class-III  60.75 
 
 		 453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0794397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.1 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.7 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  29.21 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  29.21 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  29.21 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  29.21 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  29.21 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  29.04 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  28.94 
 
 		 454 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.63 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.9 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  32.57 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.45 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  31.37 
 
 		 419 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  31.38 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.08 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  29.46 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.48 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.1 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  26.71 
 
 		 441 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  28.98 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.42 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  30.18 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  30.18 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  28.85 
 
 		 438 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.14 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  29.67 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.85 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.06 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  29.23 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.89 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.53 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  29.29 
 
 		 427 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  29.91 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.59 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  29.18 
 
 		 465 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.08 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  29.58 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  31.34 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  29.84 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  31.16 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  32.32 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  29.93 
 
 		 963 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  28.84 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  28.84 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  29.41 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  27.36 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.85 
 
 		 458 aa  173  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  28.31 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  28.81 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  29.11 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  28.61 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  28.9 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.33 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  29.07 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.49 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.54 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  28.31 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.26 
 
 		 967 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  28.81 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  28.31 
 
 		 426 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  28.31 
 
 		 426 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  28.31 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  28.84 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  28.84 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28.07 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  28.07 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  28.41 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  29.04 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  28.41 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  27.63 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  29.3 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.74 
 
 		 958 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  28.64 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.4 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  28.07 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  27.68 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  33.72 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  28.94 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  30.36 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  32.36 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>