More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6551 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 319 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7202  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.17 
 
 		 336 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  42.51 
 
 		 336 aa  281  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  28.04 
 
 		 418 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  38.93 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  39.46 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  34.12 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  34.13 
 
 		 537 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  32.94 
 
 		 398 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 428 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 427 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  25.75 
 
 		 423 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.05 
 
 		 380 aa  89.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  26.12 
 
 		 424 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  27.06 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.54 
 
 		 375 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  24.73 
 
 		 410 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 		 513 aa  85.9  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.54 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.79 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  33.33 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  33.81 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  31.97 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  33.56 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.13 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.21 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  30.82 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  30.43 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  31.43 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  30.82 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  31.79 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.5 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  35.29 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  32.19 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  31.16 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  28.08 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.97 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.36 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2753  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.853922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  32.62 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.41 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  31.88 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.5 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  29.8 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  32.39 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.93 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  29.45 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 526 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  30.07 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  36.7 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  24.8 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 465 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 486 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2325  RND family efflux transporter MFP subunit  22.17 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>