More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0472  Beta-glucosidase  68.58 
 
 		 985 aa  1335    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.571206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02280  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 1001 aa  2008    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0284984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2107  glycoside hydrolase family 3 protein  27.48 
 
 		 928 aa  274  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136681  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17700  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  26.61 
 
 		 807 aa  234  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1596  glycoside hydrolase family 3 protein  33.03 
 
 		 852 aa  184  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000479393  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  31.68 
 
 		 701 aa  177  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  29.91 
 
 		 814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.56 
 
 		 714 aa  167  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.92 
 
 		 721 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.15 
 
 		 722 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 		 717 aa  164  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  35.77 
 
 		 708 aa  162  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.91 
 
 		 818 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 		 742 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 749 aa  160  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 758 aa  160  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.93 
 
 		 750 aa  157  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  37.99 
 
 		 749 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.9 
 
 		 747 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.9 
 
 		 813 aa  149  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  33.45 
 
 		 740 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  35.2 
 
 		 845 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.61 
 
 		 814 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  33.22 
 
 		 823 aa  144  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  33.1 
 
 		 750 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.58 
 
 		 777 aa  141  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19430  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.02 
 
 		 829 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.65 
 
 		 748 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  34.8 
 
 		 762 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  32.58 
 
 		 895 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 		 751 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.41 
 
 		 820 aa  137  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  37 
 
 		 805 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  33.84 
 
 		 760 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  32.22 
 
 		 757 aa  135  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  31.22 
 
 		 745 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  34.84 
 
 		 843 aa  135  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.36 
 
 		 755 aa  135  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 757 aa  134  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.88 
 
 		 746 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  30.38 
 
 		 833 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 755 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  31.97 
 
 		 850 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  28.7 
 
 		 914 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  28.41 
 
 		 915 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  30.83 
 
 		 800 aa  132  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  32.69 
 
 		 884 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.2 
 
 		 741 aa  132  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.44 
 
 		 757 aa  131  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  31.4 
 
 		 838 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 		 758 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.29 
 
 		 809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  33.76 
 
 		 874 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  30.15 
 
 		 851 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 829 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  30.8 
 
 		 843 aa  129  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 913 aa  128  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.58 
 
 		 737 aa  128  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  32.86 
 
 		 836 aa  127  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.46 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 		 831 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  29.66 
 
 		 839 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.04 
 
 		 711 aa  125  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  30.49 
 
 		 738 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  36.51 
 
 		 906 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  27.42 
 
 		 737 aa  124  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.31 
 
 		 790 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.67 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  31.12 
 
 		 897 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 		 832 aa  121  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  30.12 
 
 		 866 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 		 813 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 734 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  30.29 
 
 		 738 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  30.29 
 
 		 738 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  25.23 
 
 		 793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  25.23 
 
 		 793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 857 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  31.14 
 
 		 549 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  31.14 
 
 		 380 aa  116  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  31.14 
 
 		 380 aa  116  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.72 
 
 		 913 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  30.77 
 
 		 922 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  32.08 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  30.77 
 
 		 731 aa  115  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 		 874 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.41 
 
 		 731 aa  114  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.72 
 
 		 870 aa  114  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  28.8 
 
 		 913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.5 
 
 		 497 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.84 
 
 		 927 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  30.6 
 
 		 887 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.65 
 
 		 724 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  33.48 
 
 		 852 aa  110  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  29.72 
 
 		 721 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  38 
 
 		 772 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  30.65 
 
 		 832 aa  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  32.81 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  32.81 
 
 		 733 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  28.75 
 
 		 931 aa  109  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>