More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2107 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2107  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
928 aa  1926    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136681  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19430  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.34 
 
 
829 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1596  glycoside hydrolase family 3 protein  38.03 
 
 
852 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000479393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17700  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.98 
 
 
807 aa  313  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02280  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.48 
 
 
1001 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0284984  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0472  Beta-glucosidase  28.44 
 
 
985 aa  263  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.571206  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  42.9 
 
 
701 aa  235  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 
714 aa  228  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  38.84 
 
 
717 aa  227  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  39.63 
 
 
814 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  44.66 
 
 
708 aa  223  9e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  38.17 
 
 
721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.93 
 
 
722 aa  221  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  34.4 
 
 
793 aa  196  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  34.11 
 
 
793 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  39.34 
 
 
800 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.37 
 
 
790 aa  191  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 
758 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 
749 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 
755 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.63 
 
 
814 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  39.93 
 
 
747 aa  187  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.89 
 
 
750 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.46 
 
 
813 aa  184  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  46.84 
 
 
845 aa  184  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 
762 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.53 
 
 
750 aa  183  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  44.98 
 
 
741 aa  181  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.76 
 
 
757 aa  181  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  40.56 
 
 
760 aa  181  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  38.55 
 
 
874 aa  180  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  44.62 
 
 
838 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.37 
 
 
818 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  42.65 
 
 
740 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 
748 aa  179  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.92 
 
 
751 aa  178  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
755 aa  177  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.31 
 
 
809 aa  176  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 
742 aa  175  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.3 
 
 
820 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  37.69 
 
 
829 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  35.88 
 
 
823 aa  174  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.57 
 
 
737 aa  173  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  37.45 
 
 
749 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 
831 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  36.53 
 
 
851 aa  171  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  36.36 
 
 
895 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.79 
 
 
777 aa  170  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  43.75 
 
 
850 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  35.44 
 
 
914 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  43 
 
 
757 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  33.11 
 
 
836 aa  168  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  42.78 
 
 
833 aa  168  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.8 
 
 
721 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.3 
 
 
757 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  39.2 
 
 
852 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.87 
 
 
758 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.14 
 
 
711 aa  164  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  31.25 
 
 
745 aa  164  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.66 
 
 
734 aa  163  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.76 
 
 
915 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 
738 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.27 
 
 
746 aa  161  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  38.43 
 
 
738 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.56 
 
 
780 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  40.25 
 
 
751 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  40.25 
 
 
751 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  41.18 
 
 
738 aa  160  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  40.4 
 
 
839 aa  159  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  39.74 
 
 
751 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  42.41 
 
 
843 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  39.74 
 
 
748 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  41.97 
 
 
843 aa  155  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  42.13 
 
 
832 aa  155  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.65 
 
 
737 aa  154  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  41.03 
 
 
805 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 
839 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  37.4 
 
 
730 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  39.48 
 
 
779 aa  153  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.03 
 
 
813 aa  148  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.79 
 
 
820 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  32.6 
 
 
866 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  29.45 
 
 
731 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  39.58 
 
 
816 aa  146  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.36 
 
 
685 aa  146  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  38.24 
 
 
870 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  35.78 
 
 
857 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  35.41 
 
 
832 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  36.79 
 
 
737 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.07 
 
 
748 aa  144  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  36.41 
 
 
887 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 
874 aa  139  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38 
 
 
724 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  36.48 
 
 
549 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  35.36 
 
 
735 aa  138  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  38.1 
 
 
931 aa  138  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  36.48 
 
 
731 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  36.48 
 
 
922 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  36.05 
 
 
380 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  36.05 
 
 
380 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>