256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2837 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  78.88 
 
 		 769 aa  1287    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  67.71 
 
 		 808 aa  1121    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  96 
 
 		 796 aa  1562    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 801 aa  1657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  47.92 
 
 		 761 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  97.88 
 
 		 801 aa  1588    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  67.35 
 
 		 808 aa  1117    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  67.34 
 
 		 745 aa  1073    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  67.07 
 
 		 808 aa  1113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  67.11 
 
 		 808 aa  1114    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  42.82 
 
 		 745 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 		 743 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  41.03 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  40.85 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  42.53 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  41.71 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  41.4 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  41.26 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 698 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 698 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  38.43 
 
 		 707 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  41.14 
 
 		 696 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  39.55 
 
 		 698 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  37.08 
 
 		 732 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  41.09 
 
 		 717 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  39.55 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  40.32 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  39.55 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  39.55 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  39.4 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 		 694 aa  366  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  39.2 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  39.2 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 731 aa  360  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.11 
 
 		 1703 aa  360  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  39.68 
 
 		 692 aa  353  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  39.68 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  39.29 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  39.5 
 
 		 692 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  39.15 
 
 		 692 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.69 
 
 		 1673 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.67 
 
 		 1730 aa  336  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.69 
 
 		 1715 aa  330  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.37 
 
 		 1464 aa  327  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.09 
 
 		 699 aa  318  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  36.84 
 
 		 728 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 		 604 aa  301  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  35.29 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  36.71 
 
 		 605 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  36.11 
 
 		 605 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  37.45 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.62 
 
 		 1662 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 664 aa  289  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 		 708 aa  287  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.71 
 
 		 619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  35.56 
 
 		 733 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.6 
 
 		 1647 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  33.16 
 
 		 717 aa  282  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 		 630 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 736 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 		 718 aa  277  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  32.6 
 
 		 736 aa  276  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  36.92 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  35.84 
 
 		 656 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  31.97 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  31.97 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 		 657 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  32.8 
 
 		 692 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.85 
 
 		 1642 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.03 
 
 		 1650 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  36.2 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.03 
 
 		 1646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.84 
 
 		 1646 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 		 721 aa  265  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  33.98 
 
 		 717 aa  264  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 663 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  32.95 
 
 		 730 aa  263  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 		 650 aa  260  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 		 646 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 717 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 		 660 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  31.03 
 
 		 749 aa  259  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.5 
 
 		 692 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 		 692 aa  258  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  32.07 
 
 		 721 aa  257  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.48 
 
 		 1633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  31.01 
 
 		 726 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 		 733 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 684 aa  254  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  32.3 
 
 		 1169 aa  253  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  31.6 
 
 		 708 aa  252  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 		 717 aa  251  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  31.39 
 
 		 721 aa  250  9e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  32.64 
 
 		 1342 aa  249  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  32.5 
 
 		 610 aa  248  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>