259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0986 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
724 aa  1504    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  36.83 
 
 
696 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  36.55 
 
 
698 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  36.55 
 
 
698 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  35.81 
 
 
694 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  36.41 
 
 
698 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  35.81 
 
 
694 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  35.81 
 
 
694 aa  425  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  35.56 
 
 
694 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 
808 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  34.46 
 
 
732 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
694 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  35.47 
 
 
726 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
694 aa  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
694 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  43.44 
 
 
801 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 
808 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
694 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  42.07 
 
 
808 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
694 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  42.07 
 
 
808 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 
796 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 
801 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  35.22 
 
 
745 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 
726 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
692 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 
692 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  42.51 
 
 
769 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
692 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 
692 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 
692 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 
732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.31 
 
 
1703 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  33.75 
 
 
726 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  33.93 
 
 
731 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  33.85 
 
 
761 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  33.98 
 
 
726 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  35.77 
 
 
745 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  37.89 
 
 
717 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  34.27 
 
 
695 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  35.24 
 
 
694 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  37.86 
 
 
707 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.73 
 
 
1715 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.87 
 
 
1730 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  36.98 
 
 
699 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  34.83 
 
 
694 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.59 
 
 
1673 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.61 
 
 
1464 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  34.56 
 
 
728 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  33.6 
 
 
743 aa  353  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.1 
 
 
1642 aa  346  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.99 
 
 
1633 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.59 
 
 
650 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.71 
 
 
1650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.38 
 
 
1646 aa  328  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.1 
 
 
1646 aa  327  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.78 
 
 
1662 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  38.24 
 
 
650 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.93 
 
 
656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.38 
 
 
1647 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  35.57 
 
 
605 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
646 aa  317  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  30.46 
 
 
733 aa  312  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  37.27 
 
 
657 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.75 
 
 
607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  34.61 
 
 
604 aa  310  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  30.25 
 
 
730 aa  310  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.27 
 
 
619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.68 
 
 
605 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 
630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
605 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 
663 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.47 
 
 
1410 aa  303  9e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  30.73 
 
 
743 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  30.26 
 
 
718 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  30.12 
 
 
743 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  34.85 
 
 
692 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 
657 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  30.64 
 
 
724 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  30.54 
 
 
708 aa  291  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 
736 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  29.53 
 
 
689 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  28.84 
 
 
717 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33 
 
 
684 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  30.12 
 
 
689 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  31.36 
 
 
735 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  30.73 
 
 
726 aa  280  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  29.6 
 
 
736 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 
721 aa  279  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1931  4-alpha-glucanotransferase  29.26 
 
 
699 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
1169 aa  277  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  31.46 
 
 
691 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  29.34 
 
 
708 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  30.25 
 
 
689 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  31.71 
 
 
682 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
692 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  33.27 
 
 
610 aa  270  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  29.97 
 
 
689 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.26 
 
 
692 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  28.29 
 
 
717 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>