260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1467 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  76.2 
 
 
663 aa  1011    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  58.45 
 
 
650 aa  720    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  57.23 
 
 
657 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  56.64 
 
 
656 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  58.83 
 
 
657 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
646 aa  1302    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  54.62 
 
 
650 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.27 
 
 
1464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.45 
 
 
1703 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
728 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.41 
 
 
1642 aa  353  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  34.7 
 
 
717 aa  352  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.81 
 
 
1673 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  34.48 
 
 
726 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.69 
 
 
1646 aa  345  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.81 
 
 
1650 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  34.34 
 
 
726 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  34.25 
 
 
726 aa  344  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
707 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.04 
 
 
1647 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 
694 aa  342  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.98 
 
 
696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  38.62 
 
 
604 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.23 
 
 
1646 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.4 
 
 
1730 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 
694 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  33.98 
 
 
694 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.38 
 
 
1662 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 
694 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 
694 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 
692 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  33.98 
 
 
694 aa  336  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  35.37 
 
 
698 aa  336  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.97 
 
 
1715 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 
694 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  34.43 
 
 
692 aa  336  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 
694 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 
692 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  35.37 
 
 
698 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  34.31 
 
 
726 aa  335  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  34.85 
 
 
732 aa  334  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  34.43 
 
 
692 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 
692 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 
698 aa  333  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 
732 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  33.68 
 
 
694 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  33.68 
 
 
694 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  37.81 
 
 
607 aa  333  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 
694 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.78 
 
 
699 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 
695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  34.55 
 
 
684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
605 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  37.68 
 
 
619 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
605 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  34.68 
 
 
731 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  38.04 
 
 
736 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 
692 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.65 
 
 
691 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.77 
 
 
1633 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
692 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  38.74 
 
 
605 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.31 
 
 
682 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
724 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 
736 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  36.88 
 
 
630 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  36.02 
 
 
726 aa  316  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  38.69 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 
669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  36.3 
 
 
689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  38.06 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  36.3 
 
 
730 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  36.12 
 
 
689 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  36.12 
 
 
689 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 
684 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  34.77 
 
 
760 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  34.77 
 
 
760 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  37.83 
 
 
689 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  33.02 
 
 
743 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  35.88 
 
 
708 aa  297  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  32.64 
 
 
697 aa  296  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  37.26 
 
 
736 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  37.7 
 
 
610 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  35.99 
 
 
724 aa  290  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  33.76 
 
 
730 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 
724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  37.36 
 
 
733 aa  283  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4424  4-alpha-glucanotransferase  35.01 
 
 
611 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  35 
 
 
735 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 
733 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 
708 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  35.45 
 
 
743 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  33.49 
 
 
717 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
702 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 
718 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  34.3 
 
 
677 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  35.36 
 
 
774 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  38.03 
 
 
745 aa  270  8.999999999999999e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  34.2 
 
 
745 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  34.57 
 
 
717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>