260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0315 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  54.75 
 
 
694 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  55.04 
 
 
694 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  56.09 
 
 
692 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  55.7 
 
 
692 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  54.81 
 
 
695 aa  778    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  57.21 
 
 
698 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  57.06 
 
 
698 aa  812    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  54.75 
 
 
694 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  73.23 
 
 
717 aa  1083    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  54.9 
 
 
694 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  64.01 
 
 
694 aa  954    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  54.9 
 
 
694 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  54.75 
 
 
694 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  54.95 
 
 
694 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  55.81 
 
 
692 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  59.67 
 
 
696 aa  820    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  54.6 
 
 
694 aa  777    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  57.21 
 
 
698 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  56.09 
 
 
692 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  56.09 
 
 
692 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  64.88 
 
 
694 aa  967    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  55.19 
 
 
694 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
707 aa  1453    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  43.72 
 
 
732 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  44.93 
 
 
726 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  44.02 
 
 
726 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  43.6 
 
 
726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  44.27 
 
 
726 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  44.44 
 
 
732 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  48.08 
 
 
731 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  39.08 
 
 
699 aa  507  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.89 
 
 
1464 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.88 
 
 
1673 aa  472  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.44 
 
 
1703 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.13 
 
 
1730 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.89 
 
 
1662 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.57 
 
 
1715 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.54 
 
 
1642 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.89 
 
 
1647 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  37.86 
 
 
724 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  39.69 
 
 
808 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  39.86 
 
 
808 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  39.86 
 
 
808 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  39.69 
 
 
808 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.75 
 
 
728 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  38.35 
 
 
769 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.07 
 
 
1650 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  37.04 
 
 
761 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.12 
 
 
1633 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  39.75 
 
 
745 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.34 
 
 
1646 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  38.43 
 
 
801 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.19 
 
 
1646 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  38.65 
 
 
801 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  38.6 
 
 
607 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  39.17 
 
 
796 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
619 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  36.71 
 
 
656 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 
726 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  39.24 
 
 
605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.1 
 
 
736 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  38.21 
 
 
630 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.77 
 
 
605 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
736 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  38.95 
 
 
605 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  36.86 
 
 
718 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  36.71 
 
 
604 aa  349  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  34.91 
 
 
735 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
646 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  35.46 
 
 
610 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  35.37 
 
 
708 aa  337  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  36.52 
 
 
708 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  33.71 
 
 
691 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 
657 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  34.46 
 
 
650 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
663 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  35.76 
 
 
745 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  32.18 
 
 
697 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  32.15 
 
 
650 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 
743 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  34.76 
 
 
682 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  34.2 
 
 
743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 
733 aa  326  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
733 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  35.9 
 
 
730 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 
692 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  31.33 
 
 
669 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  39.34 
 
 
740 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
684 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  39.34 
 
 
740 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 
743 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  30.97 
 
 
692 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  33.54 
 
 
760 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  38.56 
 
 
729 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  33.54 
 
 
760 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 
657 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.86 
 
 
1410 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  38.57 
 
 
736 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  33.48 
 
 
766 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>