260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2365 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  46.16 
 
 
726 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  48.44 
 
 
731 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  46.2 
 
 
726 aa  695    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  45.59 
 
 
726 aa  692    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  45.92 
 
 
726 aa  691    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
732 aa  1516    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  48.56 
 
 
732 aa  735    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  43.09 
 
 
692 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 
692 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  43.09 
 
 
692 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 
692 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  43.76 
 
 
698 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  43.76 
 
 
698 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 
692 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  43.62 
 
 
698 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 
695 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  42.48 
 
 
694 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  42.33 
 
 
694 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  41.84 
 
 
694 aa  592  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  42.33 
 
 
694 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  42.33 
 
 
694 aa  591  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  42.33 
 
 
694 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  42.19 
 
 
694 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  42.33 
 
 
694 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  41.91 
 
 
694 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  44.44 
 
 
707 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  48.33 
 
 
717 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  41.84 
 
 
694 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  41.56 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  42.28 
 
 
696 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.69 
 
 
1703 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.51 
 
 
1464 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.57 
 
 
1673 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.71 
 
 
1715 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  39.66 
 
 
699 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.86 
 
 
1730 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  34.46 
 
 
724 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.94 
 
 
1662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 
808 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  32.16 
 
 
728 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 
808 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  39.22 
 
 
808 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  33.42 
 
 
745 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 
808 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  32.67 
 
 
769 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.87 
 
 
1642 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  38.26 
 
 
801 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  38.26 
 
 
801 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.01 
 
 
1647 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  37.91 
 
 
796 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 
761 aa  369  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.88 
 
 
1650 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.91 
 
 
1646 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.68 
 
 
1633 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.89 
 
 
1646 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  33.04 
 
 
607 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 
605 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 
605 aa  351  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 
692 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.3 
 
 
605 aa  351  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  31.58 
 
 
726 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.31 
 
 
692 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  29.54 
 
 
736 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  30.21 
 
 
733 aa  342  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 
736 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 
745 aa  340  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  28.94 
 
 
692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 
646 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  33.75 
 
 
604 aa  332  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 
619 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
663 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  30.49 
 
 
730 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  28.74 
 
 
689 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  30.15 
 
 
708 aa  327  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  30.22 
 
 
689 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  29.69 
 
 
689 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  28.18 
 
 
760 aa  324  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  28.18 
 
 
760 aa  324  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.13 
 
 
650 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1931  4-alpha-glucanotransferase  30.35 
 
 
699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  32.88 
 
 
610 aa  320  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  28.07 
 
 
691 aa  320  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  29.85 
 
 
689 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 
733 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
684 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  33.95 
 
 
656 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  29.76 
 
 
718 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  29.71 
 
 
708 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  27.95 
 
 
669 aa  311  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1850  4-alpha-glucanotransferase  28.37 
 
 
690 aa  310  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.91 
 
 
630 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  27.9 
 
 
724 aa  308  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  30.35 
 
 
749 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 
697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  28.74 
 
 
774 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  28.09 
 
 
717 aa  303  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  29.12 
 
 
682 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  28.8 
 
 
730 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  29.49 
 
 
717 aa  301  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
657 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>