259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5113 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  55.05 
 
 
604 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  81.23 
 
 
630 aa  1001    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
619 aa  1254    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  44.89 
 
 
607 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  44.81 
 
 
605 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  45.05 
 
 
605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  45.05 
 
 
605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.53 
 
 
1703 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.35 
 
 
1464 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.38 
 
 
1673 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.45 
 
 
1662 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  38.28 
 
 
694 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.72 
 
 
1730 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  38.31 
 
 
694 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  38.01 
 
 
698 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  38.01 
 
 
698 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  39.78 
 
 
692 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  39.78 
 
 
692 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  39.71 
 
 
692 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  39.71 
 
 
692 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  39.78 
 
 
692 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
707 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.83 
 
 
1642 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.43 
 
 
1650 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  37.83 
 
 
698 aa  362  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  37.88 
 
 
717 aa  361  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.78 
 
 
1715 aa  359  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.89 
 
 
1633 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  38.14 
 
 
694 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  38.32 
 
 
695 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  38.28 
 
 
694 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  38.14 
 
 
694 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  38.32 
 
 
694 aa  355  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 
694 aa  355  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  38.14 
 
 
694 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  38.14 
 
 
694 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  38.14 
 
 
694 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.1 
 
 
1646 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  37.96 
 
 
694 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  38.32 
 
 
696 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.26 
 
 
1647 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.35 
 
 
650 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.9 
 
 
1646 aa  350  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  36.6 
 
 
732 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  39.82 
 
 
656 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 
663 aa  336  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  34.52 
 
 
726 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 
726 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  37.52 
 
 
728 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  34.46 
 
 
726 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  34.77 
 
 
731 aa  331  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 
732 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  37.68 
 
 
646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 
699 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  34.1 
 
 
726 aa  326  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  38.83 
 
 
657 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  36.86 
 
 
692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  34.27 
 
 
724 aa  309  8e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  37.75 
 
 
650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  35.02 
 
 
692 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  38.17 
 
 
657 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 
735 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  34.82 
 
 
682 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  34.31 
 
 
669 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  37.98 
 
 
1342 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  36.21 
 
 
689 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  34.4 
 
 
760 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 
808 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  34.4 
 
 
760 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  34.86 
 
 
684 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  32.73 
 
 
808 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  35.63 
 
 
736 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.23 
 
 
808 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.67 
 
 
808 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  34.74 
 
 
769 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
736 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.96 
 
 
796 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  34.04 
 
 
724 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  36.19 
 
 
1410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  34.15 
 
 
801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 
684 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  34.15 
 
 
801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.22 
 
 
708 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 
689 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 
733 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  37.71 
 
 
691 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  35.71 
 
 
689 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  35.57 
 
 
610 aa  278  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.17 
 
 
664 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  30.57 
 
 
761 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  33.86 
 
 
718 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  35.53 
 
 
689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 
726 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  39.33 
 
 
729 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 
740 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 
740 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  35.9 
 
 
708 aa  273  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  35.53 
 
 
717 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  34.69 
 
 
745 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>