259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  50.42 
 
 
717 aa  643    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  51.4 
 
 
724 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  62.12 
 
 
733 aa  854    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  64.63 
 
 
717 aa  874    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  57.02 
 
 
712 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  52.06 
 
 
730 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  51.42 
 
 
708 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
718 aa  1435    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  53.3 
 
 
717 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  49.29 
 
 
730 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  50.55 
 
 
724 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  65.32 
 
 
708 aa  874    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  48.8 
 
 
721 aa  611  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  50.07 
 
 
719 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  50.07 
 
 
719 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  50.07 
 
 
719 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  44.04 
 
 
721 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  43.94 
 
 
749 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  45.98 
 
 
702 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  46.48 
 
 
717 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  43.76 
 
 
745 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  45.38 
 
 
677 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 
721 aa  550  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  46.47 
 
 
1169 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  46.99 
 
 
766 aa  482  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  42.35 
 
 
757 aa  452  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  45.26 
 
 
780 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  40.83 
 
 
692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  40.64 
 
 
660 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.97 
 
 
1464 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  41.03 
 
 
610 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  37.89 
 
 
717 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
732 aa  361  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  36.86 
 
 
707 aa  351  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  36.8 
 
 
698 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  36.8 
 
 
698 aa  344  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  36.63 
 
 
698 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  37.12 
 
 
694 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.73 
 
 
1715 aa  336  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  36.93 
 
 
694 aa  333  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  33.15 
 
 
726 aa  332  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 
728 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.29 
 
 
1730 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.95 
 
 
1673 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.82 
 
 
696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  32.63 
 
 
694 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
694 aa  318  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
694 aa  317  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
694 aa  317  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  31.94 
 
 
694 aa  317  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.95 
 
 
726 aa  317  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.78 
 
 
726 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.31 
 
 
694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.17 
 
 
694 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  32.17 
 
 
694 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  36.76 
 
 
607 aa  313  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  32.64 
 
 
695 aa  313  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.77 
 
 
692 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.02 
 
 
1642 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  29.76 
 
 
732 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.63 
 
 
692 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.63 
 
 
692 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 
726 aa  311  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 
605 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.63 
 
 
692 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.02 
 
 
731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 
692 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.92 
 
 
605 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 
664 aa  302  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.95 
 
 
1646 aa  302  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.61 
 
 
1703 aa  301  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
605 aa  301  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  32.36 
 
 
699 aa  300  8e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.43 
 
 
1646 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  30.26 
 
 
724 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.14 
 
 
1647 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.69 
 
 
1662 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
692 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  35.77 
 
 
808 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 
808 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 
808 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.7 
 
 
1650 aa  289  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  34.42 
 
 
761 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  35.36 
 
 
808 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  33.22 
 
 
604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  36.19 
 
 
769 aa  282  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
692 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.67 
 
 
1633 aa  280  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  32.36 
 
 
726 aa  280  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
736 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  35.47 
 
 
796 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 
646 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 
801 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  36.03 
 
 
801 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  33.86 
 
 
619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.77 
 
 
692 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  30.75 
 
 
736 aa  273  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.9 
 
 
684 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 
745 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>