260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0039 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  48.02 
 
 		 694 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  48.16 
 
 		 694 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 726 aa  1502    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  48.51 
 
 		 696 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  47.6 
 
 		 694 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  48.02 
 
 		 694 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  47.99 
 
 		 698 aa  688    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  47.88 
 
 		 694 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  48.02 
 
 		 694 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  74.48 
 
 		 726 aa  1154    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  47.05 
 
 		 692 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  47.88 
 
 		 694 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  47.19 
 
 		 692 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  47.61 
 
 		 692 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  47.89 
 
 		 732 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  47.32 
 
 		 731 aa  670    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  47.77 
 
 		 694 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  48.13 
 
 		 698 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  46.91 
 
 		 692 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  75.31 
 
 		 726 aa  1159    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  47.33 
 
 		 692 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  46.16 
 
 		 732 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  48.13 
 
 		 698 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  48.16 
 
 		 694 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  47.77 
 
 		 695 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  74.76 
 
 		 726 aa  1143    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  44.94 
 
 		 717 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  44.21 
 
 		 694 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  43.65 
 
 		 694 aa  598  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  44.27 
 
 		 707 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.65 
 
 		 1703 aa  522  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.78 
 
 		 1673 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.59 
 
 		 1730 aa  492  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  38.42 
 
 		 699 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.14 
 
 		 1715 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 		 1464 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.23 
 
 		 1662 aa  452  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  35.47 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  40.03 
 
 		 745 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  41.71 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  41.88 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  41.91 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  41.91 
 
 		 808 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  41.36 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  41.91 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  41.88 
 
 		 808 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  41.55 
 
 		 769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.83 
 
 		 1642 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.74 
 
 		 1647 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.13 
 
 		 728 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  32.92 
 
 		 736 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  35.63 
 
 		 761 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.48 
 
 		 1646 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.57 
 
 		 1650 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33 
 
 		 1646 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.23 
 
 		 1633 aa  364  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 736 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.29 
 
 		 726 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  38.01 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  32.3 
 
 		 691 aa  347  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 		 684 aa  346  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.09 
 
 		 605 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  38.09 
 
 		 605 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  36.53 
 
 		 604 aa  340  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  30.08 
 
 		 669 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 		 708 aa  337  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.31 
 
 		 646 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 		 619 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  35.68 
 
 		 745 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  32.44 
 
 		 656 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  36.28 
 
 		 650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  31.1 
 
 		 745 aa  327  5e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  30.54 
 
 		 697 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 		 663 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  35.41 
 
 		 607 aa  325  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 733 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 		 721 aa  323  8e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  31.9 
 
 		 730 aa  323  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 730 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  37.76 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 692 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 		 692 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  33.99 
 
 		 743 aa  321  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  30.96 
 
 		 760 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  30.96 
 
 		 760 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  30.87 
 
 		 721 aa  320  6e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  31.56 
 
 		 708 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.22 
 
 		 692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  31.01 
 
 		 717 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  33.13 
 
 		 657 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  30.31 
 
 		 733 aa  313  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  31.53 
 
 		 749 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 718 aa  311  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 		 657 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  29.96 
 
 		 743 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  30.12 
 
 		 689 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  30.22 
 
 		 743 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  31.44 
 
 		 774 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  29.76 
 
 		 682 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  32.52 
 
 		 650 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>