259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1299 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  62.23 
 
 		 745 aa  900    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 749 aa  1551    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  50.82 
 
 		 721 aa  727    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  47.87 
 
 		 721 aa  685    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  43.94 
 
 		 718 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  44.89 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  42.54 
 
 		 733 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  43.09 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  40.73 
 
 		 724 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  42.13 
 
 		 730 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  42.99 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  41.45 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  40.54 
 
 		 724 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  42.06 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  39.61 
 
 		 730 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  40.47 
 
 		 721 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  40.42 
 
 		 717 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  39.89 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  40.92 
 
 		 719 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  40.92 
 
 		 719 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  40.92 
 
 		 719 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  41.45 
 
 		 1169 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  37.77 
 
 		 677 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  35.34 
 
 		 766 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  37.08 
 
 		 660 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  36.98 
 
 		 757 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  36.7 
 
 		 780 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  36.54 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.17 
 
 		 726 aa  347  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.39 
 
 		 1642 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.7 
 
 		 726 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.88 
 
 		 726 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.58 
 
 		 1647 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.73 
 
 		 695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.87 
 
 		 694 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  36.27 
 
 		 610 aa  320  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  30.31 
 
 		 732 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  31.53 
 
 		 726 aa  318  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.52 
 
 		 717 aa  317  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 		 694 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 		 694 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  33.23 
 
 		 694 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 		 694 aa  311  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 		 694 aa  310  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.17 
 
 		 698 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.74 
 
 		 694 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  31.74 
 
 		 694 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.17 
 
 		 698 aa  310  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 		 694 aa  310  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 		 694 aa  310  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.03 
 
 		 698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.89 
 
 		 1703 aa  307  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  31.6 
 
 		 694 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.62 
 
 		 1715 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.47 
 
 		 731 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  31.86 
 
 		 692 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.72 
 
 		 1464 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  31.86 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  32.67 
 
 		 707 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.05 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.42 
 
 		 1646 aa  298  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.31 
 
 		 692 aa  297  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  31.77 
 
 		 692 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  32.23 
 
 		 696 aa  295  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.35 
 
 		 1673 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.19 
 
 		 1633 aa  293  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.14 
 
 		 1646 aa  292  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.04 
 
 		 1650 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 		 728 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.38 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  32.16 
 
 		 726 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  32.55 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  31.73 
 
 		 689 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.38 
 
 		 808 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 		 769 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  29.97 
 
 		 1730 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  32.21 
 
 		 808 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  32.72 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  31.83 
 
 		 689 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 692 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  30.14 
 
 		 692 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  31.55 
 
 		 689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 736 aa  275  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  31.59 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 761 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 801 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  29.9 
 
 		 736 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.27 
 
 		 796 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  32.08 
 
 		 745 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  32.21 
 
 		 646 aa  270  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  31.18 
 
 		 801 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  30.11 
 
 		 669 aa  264  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  28.99 
 
 		 724 aa  264  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 605 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.55 
 
 		 692 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  29.68 
 
 		 699 aa  260  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  33.16 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  30.79 
 
 		 745 aa  258  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>