259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1157 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 757 aa  1457    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  63.72 
 
 		 780 aa  756    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  45.36 
 
 		 724 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  45.96 
 
 		 708 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  44.94 
 
 		 730 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  46.79 
 
 		 677 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  48.82 
 
 		 717 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  44.91 
 
 		 730 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  46.1 
 
 		 719 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  44.97 
 
 		 733 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  46.1 
 
 		 719 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  46.1 
 
 		 719 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  44.83 
 
 		 724 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  45.6 
 
 		 708 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  42.49 
 
 		 718 aa  505  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  43.9 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  47.49 
 
 		 660 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  43.89 
 
 		 702 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  44.08 
 
 		 717 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  46.46 
 
 		 712 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  50.59 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  43.23 
 
 		 766 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  39.18 
 
 		 721 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  44.9 
 
 		 717 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  42.43 
 
 		 721 aa  449  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 		 721 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  38.27 
 
 		 749 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  37.89 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  40.32 
 
 		 1169 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  41.58 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.81 
 
 		 1703 aa  346  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.37 
 
 		 1464 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.94 
 
 		 1673 aa  337  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  29.69 
 
 		 732 aa  336  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  35.02 
 
 		 717 aa  333  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.05 
 
 		 1715 aa  330  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.19 
 
 		 698 aa  330  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.19 
 
 		 698 aa  329  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.05 
 
 		 698 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.2 
 
 		 1730 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  29.92 
 
 		 731 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.59 
 
 		 707 aa  325  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  33.61 
 
 		 694 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  34.26 
 
 		 696 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.97 
 
 		 732 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.09 
 
 		 694 aa  316  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.6 
 
 		 726 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  30.45 
 
 		 695 aa  311  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  31.63 
 
 		 726 aa  310  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.84 
 
 		 726 aa  306  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.07 
 
 		 726 aa  306  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 694 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 694 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.76 
 
 		 694 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.48 
 
 		 694 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.62 
 
 		 694 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.62 
 
 		 694 aa  303  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.62 
 
 		 694 aa  303  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.62 
 
 		 694 aa  303  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.62 
 
 		 694 aa  303  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  31.49 
 
 		 692 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  31.55 
 
 		 692 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  36.2 
 
 		 682 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.77 
 
 		 728 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  31.35 
 
 		 692 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  31.35 
 
 		 692 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.98 
 
 		 605 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  31.35 
 
 		 692 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.17 
 
 		 1662 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.67 
 
 		 1642 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.68 
 
 		 607 aa  294  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  28.85 
 
 		 724 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  37.93 
 
 		 664 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  37.59 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  32.12 
 
 		 692 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 		 692 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  36.6 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  29.59 
 
 		 761 aa  280  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 		 692 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 646 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 		 684 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  29.34 
 
 		 699 aa  276  9e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  33.88 
 
 		 760 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  33.88 
 
 		 760 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  32.1 
 
 		 689 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.01 
 
 		 656 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.42 
 
 		 684 aa  271  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 		 733 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  33.76 
 
 		 691 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  32.24 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  31.83 
 
 		 689 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.41 
 
 		 1647 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.25 
 
 		 1646 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  31.36 
 
 		 689 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.43 
 
 		 1646 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  35.22 
 
 		 736 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 663 aa  264  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  31.91 
 
 		 604 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  33.21 
 
 		 630 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  32.34 
 
 		 796 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>