260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1210 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 663 aa  1355    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  52.91 
 
 		 657 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  53.44 
 
 		 656 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  54.13 
 
 		 657 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  76.2 
 
 		 646 aa  1011    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  54.35 
 
 		 650 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  53.07 
 
 		 650 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.86 
 
 		 1464 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.31 
 
 		 1703 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.87 
 
 		 1642 aa  353  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.14 
 
 		 1673 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  39.44 
 
 		 728 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.82 
 
 		 726 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  35.87 
 
 		 698 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  38.06 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  35.87 
 
 		 698 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  35.71 
 
 		 698 aa  345  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.01 
 
 		 1646 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.41 
 
 		 1650 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 		 717 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.68 
 
 		 1646 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 		 726 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.74 
 
 		 696 aa  336  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 		 619 aa  336  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.87 
 
 		 1730 aa  334  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.89 
 
 		 694 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  37.05 
 
 		 607 aa  333  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  39.24 
 
 		 605 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.22 
 
 		 726 aa  333  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  32.79 
 
 		 694 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 707 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.56 
 
 		 1662 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  38.27 
 
 		 605 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  37.12 
 
 		 630 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.86 
 
 		 1647 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.93 
 
 		 605 aa  330  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  31.15 
 
 		 732 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.35 
 
 		 1715 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  33.72 
 
 		 732 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.69 
 
 		 692 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.69 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34.08 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  34.59 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 726 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.69 
 
 		 692 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  34.44 
 
 		 689 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 		 699 aa  324  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  31.97 
 
 		 694 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.51 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  33.84 
 
 		 731 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.82 
 
 		 694 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.82 
 
 		 694 aa  321  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  31.82 
 
 		 694 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 		 694 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 694 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  31.7 
 
 		 684 aa  320  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 694 aa  320  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 694 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  31.76 
 
 		 694 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  33.54 
 
 		 682 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 		 689 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  36.45 
 
 		 726 aa  316  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  35.81 
 
 		 736 aa  316  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  32.01 
 
 		 760 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  32.01 
 
 		 760 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 736 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  34.22 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.33 
 
 		 1633 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.86 
 
 		 695 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  32.83 
 
 		 689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.38 
 
 		 691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 		 724 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 		 610 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 		 692 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  32.23 
 
 		 684 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.7 
 
 		 664 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 		 730 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.57 
 
 		 708 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  32.09 
 
 		 697 aa  287  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  33.67 
 
 		 724 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 		 733 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 733 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 		 736 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  32.94 
 
 		 735 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  35.98 
 
 		 1342 aa  273  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  33.59 
 
 		 630 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  29.77 
 
 		 724 aa  271  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  32.66 
 
 		 769 aa  270  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  34.8 
 
 		 708 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 		 677 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  30.89 
 
 		 774 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.76 
 
 		 801 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  33.09 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  32.55 
 
 		 745 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.03 
 
 		 796 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  32.91 
 
 		 808 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  33.03 
 
 		 808 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>