260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0890 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 699 aa  1446    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  43.92 
 
 		 694 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  44.01 
 
 		 694 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  40.29 
 
 		 717 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  43.73 
 
 		 694 aa  512  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  43.51 
 
 		 694 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  43.56 
 
 		 694 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  39.08 
 
 		 707 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 		 698 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  43.56 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  39.51 
 
 		 698 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  39.51 
 
 		 698 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  43.56 
 
 		 694 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  43.56 
 
 		 694 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  43.39 
 
 		 694 aa  505  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  42.56 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  43.39 
 
 		 694 aa  505  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  43.39 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  43.14 
 
 		 695 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  38.42 
 
 		 726 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 		 726 aa  482  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  37.09 
 
 		 726 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  37.74 
 
 		 726 aa  479  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  40.4 
 
 		 732 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  39.66 
 
 		 732 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  39.56 
 
 		 731 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.37 
 
 		 1703 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.86 
 
 		 1673 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.65 
 
 		 1715 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.83 
 
 		 1464 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  36.98 
 
 		 724 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.97 
 
 		 1730 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.68 
 
 		 1662 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.52 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  32.7 
 
 		 604 aa  337  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 		 605 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.26 
 
 		 630 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 605 aa  333  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  32.21 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 		 619 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.78 
 
 		 646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.35 
 
 		 1642 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  34.32 
 
 		 808 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 728 aa  326  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.83 
 
 		 1647 aa  326  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 657 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  34.69 
 
 		 769 aa  325  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 745 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 		 650 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 		 808 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 		 663 aa  324  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  33.04 
 
 		 761 aa  323  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 		 808 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  35.2 
 
 		 656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 		 808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  33.09 
 
 		 733 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  34.09 
 
 		 801 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  34.09 
 
 		 801 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.66 
 
 		 1646 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.74 
 
 		 796 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.04 
 
 		 1650 aa  312  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.17 
 
 		 1646 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  30.14 
 
 		 730 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  33.09 
 
 		 657 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.18 
 
 		 1633 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  31.37 
 
 		 708 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  32.06 
 
 		 730 aa  301  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  32.36 
 
 		 718 aa  300  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  31.54 
 
 		 708 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  32.05 
 
 		 743 aa  297  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.8 
 
 		 1410 aa  296  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  29.87 
 
 		 677 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 736 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  31.29 
 
 		 743 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  31.03 
 
 		 689 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  30.82 
 
 		 736 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  31.08 
 
 		 745 aa  292  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  32.57 
 
 		 610 aa  291  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  30.77 
 
 		 743 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  32.87 
 
 		 717 aa  290  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  33.45 
 
 		 721 aa  290  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  31.48 
 
 		 726 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  31.74 
 
 		 724 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 689 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  31.59 
 
 		 717 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1931  4-alpha-glucanotransferase  28.3 
 
 		 699 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 733 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  30.75 
 
 		 735 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  30.56 
 
 		 724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  30.82 
 
 		 697 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  30.36 
 
 		 721 aa  283  7.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  31.53 
 
 		 712 aa  283  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  28.55 
 
 		 692 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 702 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>