256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1493 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 769 aa  1589    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  66.05 
 
 		 808 aa  1076    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  66.54 
 
 		 808 aa  1082    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  79.5 
 
 		 796 aa  1273    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  78.88 
 
 		 801 aa  1278    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  48.51 
 
 		 761 aa  738    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  66.05 
 
 		 808 aa  1075    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  78.36 
 
 		 801 aa  1275    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  68.76 
 
 		 745 aa  1068    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  66.17 
 
 		 808 aa  1076    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  45.49 
 
 		 745 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  37.86 
 
 		 743 aa  485  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  41.14 
 
 		 726 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  40 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  42.03 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  42.51 
 
 		 724 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  41.55 
 
 		 726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  40.92 
 
 		 694 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  40.41 
 
 		 694 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  33.29 
 
 		 732 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  38.35 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  32.67 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  37.97 
 
 		 698 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  37.97 
 
 		 698 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  38.91 
 
 		 694 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  37.82 
 
 		 698 aa  376  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  39.53 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  39.36 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  33.71 
 
 		 731 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  39.36 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  39.36 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  38.95 
 
 		 695 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  39.36 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  39.36 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  40.85 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  41.56 
 
 		 717 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  40.78 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  39.36 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  39.06 
 
 		 692 aa  360  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  38.89 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  38.89 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  39.06 
 
 		 692 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  39.06 
 
 		 692 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.11 
 
 		 1703 aa  348  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.4 
 
 		 1730 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.24 
 
 		 1715 aa  327  7e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  36.64 
 
 		 1464 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.69 
 
 		 699 aa  325  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 		 728 aa  318  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.99 
 
 		 1673 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  34.98 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  35.08 
 
 		 607 aa  298  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.79 
 
 		 1662 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  36.33 
 
 		 605 aa  292  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.74 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  36.33 
 
 		 605 aa  291  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.38 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  35.76 
 
 		 630 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  36.08 
 
 		 708 aa  286  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.09 
 
 		 1647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  34.12 
 
 		 733 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  36.19 
 
 		 718 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.05 
 
 		 1642 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 		 717 aa  279  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  32.98 
 
 		 736 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 736 aa  277  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.92 
 
 		 656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 664 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 663 aa  270  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.88 
 
 		 1650 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  35.75 
 
 		 650 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  34.82 
 
 		 717 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  32.87 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 		 717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  33.79 
 
 		 721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33 
 
 		 1646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  30.73 
 
 		 760 aa  268  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  30.73 
 
 		 760 aa  268  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.21 
 
 		 646 aa  266  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.65 
 
 		 1646 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  33.88 
 
 		 749 aa  263  8e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  33.4 
 
 		 721 aa  263  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  32.39 
 
 		 708 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  32.39 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  32.89 
 
 		 721 aa  260  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  36.41 
 
 		 657 aa  260  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  34.82 
 
 		 657 aa  260  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  30.88 
 
 		 692 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  31.71 
 
 		 724 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 730 aa  257  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  32.44 
 
 		 1169 aa  256  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 726 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  31.97 
 
 		 650 aa  254  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.48 
 
 		 1633 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.16 
 
 		 692 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  31.57 
 
 		 669 aa  251  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  35.09 
 
 		 717 aa  249  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.81 
 
 		 1410 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  32.71 
 
 		 1342 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 733 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>