260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1885 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  78.03 
 
 		 650 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  53.06 
 
 		 663 aa  686    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  62.83 
 
 		 650 aa  811    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 657 aa  1331    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  68.61 
 
 		 656 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  85.54 
 
 		 657 aa  1129    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  57.38 
 
 		 646 aa  733    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.38 
 
 		 1464 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  39.93 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 		 717 aa  350  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.66 
 
 		 1673 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  38.62 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  35.34 
 
 		 726 aa  343  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.23 
 
 		 1703 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  35.05 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  34.48 
 
 		 692 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  40.84 
 
 		 605 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.36 
 
 		 1715 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.41 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.92 
 
 		 707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  35.17 
 
 		 726 aa  337  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  38.41 
 
 		 605 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  34.26 
 
 		 696 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.29 
 
 		 1642 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  33.73 
 
 		 694 aa  332  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.03 
 
 		 694 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 		 699 aa  331  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.01 
 
 		 1730 aa  330  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  33.73 
 
 		 694 aa  329  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  33.88 
 
 		 694 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 		 694 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  33.58 
 
 		 694 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 694 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 694 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  33.58 
 
 		 694 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 		 726 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 		 698 aa  326  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 		 698 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  38.53 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.71 
 
 		 698 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  37.87 
 
 		 604 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  33.84 
 
 		 692 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.57 
 
 		 1662 aa  323  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  33.69 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.52 
 
 		 664 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  34.94 
 
 		 732 aa  320  7.999999999999999e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 692 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.72 
 
 		 1646 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.8 
 
 		 1647 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40 
 
 		 1650 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 		 692 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 695 aa  317  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  34.29 
 
 		 689 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 		 692 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 		 724 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.29 
 
 		 1646 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 		 692 aa  313  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  33.72 
 
 		 732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.39 
 
 		 1633 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 736 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  34.55 
 
 		 731 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  34.29 
 
 		 684 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  35.89 
 
 		 691 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  38.76 
 
 		 726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  32.69 
 
 		 689 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  35.14 
 
 		 689 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 		 689 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  37.29 
 
 		 736 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  33.49 
 
 		 682 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 		 760 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 		 760 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  32.41 
 
 		 724 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  35.65 
 
 		 808 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  35.74 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  35.65 
 
 		 808 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  35.26 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  35.33 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  35.65 
 
 		 808 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  35.47 
 
 		 808 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  37.89 
 
 		 1342 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  33.49 
 
 		 684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4424  4-alpha-glucanotransferase  37.96 
 
 		 611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  32.73 
 
 		 669 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  36.26 
 
 		 801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  36.26 
 
 		 801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  36.22 
 
 		 730 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.27 
 
 		 708 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  36.26 
 
 		 796 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  33.84 
 
 		 724 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  31.63 
 
 		 717 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  33.57 
 
 		 697 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 733 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 719 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  35.39 
 
 		 745 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 719 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 719 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>