256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1461 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
697 aa  1382    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  46.13 
 
 
736 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  45.16 
 
 
736 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  45.92 
 
 
726 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  44.89 
 
 
669 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  45.4 
 
 
684 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  42.12 
 
 
692 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  44.49 
 
 
691 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  41.45 
 
 
692 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  44.26 
 
 
692 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 
733 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  41.79 
 
 
760 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  41.79 
 
 
760 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  43.55 
 
 
689 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  43.67 
 
 
689 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 
689 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  43.53 
 
 
689 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  43.81 
 
 
664 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  43.2 
 
 
743 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  43.21 
 
 
743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  42.03 
 
 
735 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  44.2 
 
 
684 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  42.51 
 
 
682 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  42.08 
 
 
774 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0817  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 
740 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1540  4-alpha-glucanotransferase  42.07 
 
 
742 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1734  4-alpha-glucanotransferase  42.32 
 
 
780 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0616  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 
740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.362451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1563  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 
740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1335  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 
740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0539  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 
740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  41.61 
 
 
740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  41.61 
 
 
740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  41.76 
 
 
729 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  44.08 
 
 
736 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.92 
 
 
1703 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.18 
 
 
1464 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.24 
 
 
1673 aa  364  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 
695 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  34.18 
 
 
698 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  34.18 
 
 
698 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  34.04 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 
692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  32.58 
 
 
694 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  40.19 
 
 
630 aa  356  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 
692 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  33.05 
 
 
692 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 
694 aa  354  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 
694 aa  354  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 
694 aa  353  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.43 
 
 
732 aa  353  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 
692 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  33.1 
 
 
692 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  32.67 
 
 
694 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.52 
 
 
694 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  32.52 
 
 
694 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  32.72 
 
 
694 aa  351  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  32.43 
 
 
694 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.16 
 
 
1715 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  32.18 
 
 
707 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.14 
 
 
694 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.62 
 
 
726 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.54 
 
 
726 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  37.48 
 
 
607 aa  333  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  31.08 
 
 
726 aa  332  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  31.35 
 
 
726 aa  331  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  31.84 
 
 
694 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  31.88 
 
 
717 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  37.6 
 
 
728 aa  326  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.14 
 
 
1642 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.4 
 
 
1646 aa  319  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.8 
 
 
1646 aa  316  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.69 
 
 
1730 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 
732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.73 
 
 
1662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.48 
 
 
1650 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 
696 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.7 
 
 
731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.1 
 
 
1647 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.61 
 
 
1633 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.73 
 
 
605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 
646 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.9 
 
 
605 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  37.64 
 
 
605 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.22 
 
 
650 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  30.82 
 
 
699 aa  296  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 
663 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  32.82 
 
 
730 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.15 
 
 
708 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  32.32 
 
 
604 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
657 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  36.11 
 
 
656 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  32.14 
 
 
724 aa  273  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  33.72 
 
 
650 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  33.27 
 
 
619 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  36.1 
 
 
1342 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.11 
 
 
724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 
657 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  33.57 
 
 
808 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  30.33 
 
 
761 aa  266  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>