256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03373 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
630 aa  1243    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  41.82 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
692 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  41.82 
 
 
692 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  43.6 
 
 
692 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  42.24 
 
 
689 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  39.92 
 
 
760 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  39.92 
 
 
760 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  39.97 
 
 
736 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  40.5 
 
 
736 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  42.63 
 
 
682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  40.62 
 
 
726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  39.7 
 
 
684 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  40.37 
 
 
689 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  42.21 
 
 
684 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  40.53 
 
 
689 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 
669 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  40.22 
 
 
689 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  39.14 
 
 
743 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  39.09 
 
 
743 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 
733 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  39.66 
 
 
774 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  40.19 
 
 
697 aa  357  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  38.52 
 
 
664 aa  357  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  37.15 
 
 
735 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  40.84 
 
 
736 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  40.62 
 
 
740 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  40.62 
 
 
740 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1734  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
780 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1335  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
740 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0616  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
740 aa  291  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.362451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0539  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
740 aa  291  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1540  4-alpha-glucanotransferase  37.7 
 
 
742 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0817  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
740 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.69 
 
 
1464 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1563  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
740 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.54 
 
 
728 aa  287  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.14 
 
 
1715 aa  277  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.16 
 
 
1642 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.28 
 
 
1647 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  37.5 
 
 
657 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.84 
 
 
646 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  36.36 
 
 
650 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  31.62 
 
 
650 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  34.46 
 
 
605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  35.2 
 
 
605 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  34.29 
 
 
605 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.85 
 
 
1673 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.66 
 
 
607 aa  264  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  33.4 
 
 
761 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 
718 aa  262  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 
732 aa  260  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.16 
 
 
726 aa  260  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  36.88 
 
 
733 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.46 
 
 
726 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.38 
 
 
656 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.93 
 
 
1703 aa  257  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 
657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  35.38 
 
 
745 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.42 
 
 
726 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.9 
 
 
1646 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.5 
 
 
726 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.48 
 
 
731 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  33.03 
 
 
745 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.71 
 
 
1646 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.55 
 
 
1730 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  30.38 
 
 
717 aa  251  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  32.88 
 
 
724 aa  250  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  29.05 
 
 
732 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  32.13 
 
 
730 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.4 
 
 
808 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.39 
 
 
698 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  32.66 
 
 
769 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  32.5 
 
 
604 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.39 
 
 
698 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  32.85 
 
 
721 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.23 
 
 
698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 
808 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.4 
 
 
808 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  29.51 
 
 
695 aa  243  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.46 
 
 
1650 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  30.78 
 
 
717 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  32.03 
 
 
808 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
796 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 
801 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
801 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.75 
 
 
1662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  29.61 
 
 
694 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.03 
 
 
1633 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  28.49 
 
 
694 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  28.49 
 
 
694 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 
694 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  29.15 
 
 
694 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.15 
 
 
694 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
694 aa  238  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
694 aa  238  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  30.58 
 
 
694 aa  238  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  29 
 
 
694 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  31.64 
 
 
730 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>