256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1320 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  66.54 
 
 		 769 aa  1082    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  98.76 
 
 		 808 aa  1644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  67.31 
 
 		 796 aa  1109    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  67.31 
 
 		 801 aa  1108    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  56.22 
 
 		 761 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 808 aa  1662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  98.39 
 
 		 808 aa  1640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  68.08 
 
 		 801 aa  1114    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  68.43 
 
 		 745 aa  1108    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  45.23 
 
 		 745 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  98.64 
 
 		 808 aa  1642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  44.77 
 
 		 743 aa  452  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  41.77 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  42.07 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  40.31 
 
 		 726 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  41.88 
 
 		 726 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  39.8 
 
 		 726 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  40.91 
 
 		 694 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  41.61 
 
 		 694 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  39.69 
 
 		 707 aa  396  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 		 732 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  39.76 
 
 		 698 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  39.09 
 
 		 694 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  39.58 
 
 		 698 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  40 
 
 		 696 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  38.93 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  39.27 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  39.09 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  39.76 
 
 		 698 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  38.92 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  38.92 
 
 		 694 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  38.92 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  38.92 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  38.92 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  38.93 
 
 		 717 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  38.41 
 
 		 695 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  38.7 
 
 		 731 aa  363  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  38.18 
 
 		 692 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 		 692 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  38.39 
 
 		 692 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  38.85 
 
 		 692 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.75 
 
 		 1703 aa  354  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  37.28 
 
 		 1464 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.07 
 
 		 1730 aa  333  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.32 
 
 		 699 aa  327  6e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.37 
 
 		 1673 aa  325  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.24 
 
 		 728 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.76 
 
 		 1715 aa  319  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 		 604 aa  308  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  36.67 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.9 
 
 		 605 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 619 aa  296  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.43 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.29 
 
 		 1642 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.7 
 
 		 664 aa  290  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  34.37 
 
 		 736 aa  290  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.91 
 
 		 607 aa  290  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  35.77 
 
 		 718 aa  290  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  35.65 
 
 		 656 aa  290  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 		 726 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  31.66 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  31.66 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 736 aa  288  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  33.81 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  34.62 
 
 		 733 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.29 
 
 		 1647 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  32.07 
 
 		 717 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.25 
 
 		 1662 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  34.04 
 
 		 721 aa  283  7.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  36.87 
 
 		 657 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.03 
 
 		 630 aa  280  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.55 
 
 		 1650 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  36.81 
 
 		 650 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.08 
 
 		 1646 aa  273  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  35.65 
 
 		 657 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 		 650 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 708 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 		 1646 aa  270  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  31.93 
 
 		 749 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  33.91 
 
 		 717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 721 aa  267  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  32.33 
 
 		 721 aa  266  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 663 aa  265  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 		 646 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.15 
 
 		 692 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.21 
 
 		 708 aa  263  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.6 
 
 		 1633 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  31.91 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  35.19 
 
 		 717 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  33.21 
 
 		 660 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 702 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.6 
 
 		 684 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  31.45 
 
 		 692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  31.37 
 
 		 724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  32.77 
 
 		 717 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 692 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 733 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>