259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2674 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
607 aa  1218    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  48.61 
 
 
605 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  47.88 
 
 
605 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  48.04 
 
 
605 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  45.15 
 
 
619 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  44.86 
 
 
630 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  43.87 
 
 
604 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.7 
 
 
1464 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.48 
 
 
1703 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  41.41 
 
 
694 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
694 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.72 
 
 
1715 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.82 
 
 
1730 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  39.71 
 
 
698 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  39.71 
 
 
698 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  39.53 
 
 
698 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.7 
 
 
1673 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  38.6 
 
 
732 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  41.79 
 
 
728 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  39.14 
 
 
707 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
692 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
692 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
692 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  38.32 
 
 
717 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  39.85 
 
 
650 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
692 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  39.07 
 
 
692 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
694 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  36.23 
 
 
731 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.42 
 
 
1642 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.63 
 
 
1662 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
694 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  37.41 
 
 
695 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  37.78 
 
 
694 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
694 aa  365  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  37.78 
 
 
694 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
694 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  37.59 
 
 
694 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
694 aa  363  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  37.59 
 
 
694 aa  363  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  40.43 
 
 
692 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  39.96 
 
 
692 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  33.87 
 
 
732 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  36.51 
 
 
726 aa  359  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  39.18 
 
 
696 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 
726 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  38.51 
 
 
1342 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  35.8 
 
 
726 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  34.52 
 
 
699 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  39.66 
 
 
657 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.65 
 
 
1647 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  39.54 
 
 
692 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.81 
 
 
1646 aa  346  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.62 
 
 
1646 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  39.25 
 
 
684 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  38.94 
 
 
736 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  38.03 
 
 
650 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  37.15 
 
 
669 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  38.48 
 
 
736 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  37.71 
 
 
610 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.49 
 
 
1633 aa  339  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  39.39 
 
 
656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  41.72 
 
 
691 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.93 
 
 
1650 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 
663 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  38.43 
 
 
657 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  38.27 
 
 
664 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  37.81 
 
 
646 aa  333  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  37.34 
 
 
726 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  35.41 
 
 
726 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  37.85 
 
 
697 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.19 
 
 
1410 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  36.76 
 
 
718 aa  324  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
708 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  38.31 
 
 
733 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  38.07 
 
 
682 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  38.03 
 
 
689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  36.78 
 
 
717 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 
724 aa  319  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  34.65 
 
 
760 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  34.65 
 
 
760 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.01 
 
 
684 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  36.24 
 
 
708 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
733 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  34.66 
 
 
730 aa  309  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  34.41 
 
 
724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  37.5 
 
 
689 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  35.08 
 
 
769 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.92 
 
 
724 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  37.31 
 
 
689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  34.8 
 
 
717 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 
801 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 
801 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 
689 aa  303  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 
796 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  35.23 
 
 
808 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  36.3 
 
 
774 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  35.23 
 
 
808 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  35.1 
 
 
808 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  35.23 
 
 
808 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>