258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1607 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 728 aa  1457    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.03 
 
 		 1464 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.05 
 
 		 1730 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.3 
 
 		 1673 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.61 
 
 		 1715 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.95 
 
 		 1703 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.27 
 
 		 1642 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  34.38 
 
 		 732 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.92 
 
 		 1650 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.49 
 
 		 1647 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.35 
 
 		 1646 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.35 
 
 		 1646 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 		 731 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  36.4 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  35.33 
 
 		 726 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  44.44 
 
 		 605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  35.13 
 
 		 726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.45 
 
 		 1633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  34.87 
 
 		 726 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  37.48 
 
 		 698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 707 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  37.48 
 
 		 698 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  44.36 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  37.32 
 
 		 698 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  44.07 
 
 		 605 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  32.16 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.61 
 
 		 1662 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  41.6 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  41.9 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 		 736 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  38.13 
 
 		 717 aa  389  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  37.67 
 
 		 694 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  37.33 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  36.24 
 
 		 726 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  35.64 
 
 		 736 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  37.26 
 
 		 696 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.88 
 
 		 694 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 		 694 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  36.53 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  35.88 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  36.04 
 
 		 694 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  35.73 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 		 694 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  35.73 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  40.38 
 
 		 650 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  36.86 
 
 		 691 aa  376  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 		 694 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  39.61 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  35.57 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  34.47 
 
 		 695 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  36.77 
 
 		 692 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  41.48 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  38.35 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  36.55 
 
 		 689 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  34.5 
 
 		 724 aa  365  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  39.65 
 
 		 663 aa  364  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 		 730 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 657 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  35.45 
 
 		 669 aa  362  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  35.29 
 
 		 692 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  35.58 
 
 		 733 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  37.08 
 
 		 730 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  36.31 
 
 		 718 aa  353  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  40.55 
 
 		 657 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 		 708 aa  351  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  35.99 
 
 		 774 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  37.71 
 
 		 604 aa  346  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  35.75 
 
 		 689 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  37.52 
 
 		 619 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.6 
 
 		 724 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  36.17 
 
 		 689 aa  340  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  37.5 
 
 		 697 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 733 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 689 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  34.94 
 
 		 684 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  37.21 
 
 		 630 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 		 699 aa  330  8e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.71 
 
 		 682 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.14 
 
 		 1410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  38.26 
 
 		 610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  35.78 
 
 		 808 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  34.5 
 
 		 717 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  34.24 
 
 		 724 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 		 808 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  38.28 
 
 		 664 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  35.63 
 
 		 769 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 		 808 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  37.15 
 
 		 717 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  35.43 
 
 		 808 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 		 743 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  38.01 
 
 		 1342 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  34.73 
 
 		 717 aa  325  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  36.66 
 
 		 801 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>