More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0211 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 1410 aa  2808    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.72 
 
 		 1464 aa  909    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3764  glycogen debranching enzyme GlgX  51.6 
 
 		 649 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  46.76 
 
 		 711 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  47.32 
 
 		 712 aa  592  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  47.21 
 
 		 721 aa  582  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.13 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  46.6 
 
 		 712 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  46.75 
 
 		 712 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3352  glycogen debranching enzyme GlgX  49.63 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  44.51 
 
 		 716 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  44.19 
 
 		 688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  48.89 
 
 		 658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2744  glycogen debranching enzyme GlgX  47.78 
 
 		 654 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  47.33 
 
 		 719 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.73 
 
 		 710 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  47.17 
 
 		 727 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  43.94 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  48.99 
 
 		 729 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.49 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  45.07 
 
 		 707 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  45.14 
 
 		 701 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  44.84 
 
 		 745 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  43.82 
 
 		 704 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  45.13 
 
 		 716 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.58 
 
 		 723 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  42.23 
 
 		 721 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  47.03 
 
 		 695 aa  566  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  45.7 
 
 		 720 aa  563  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  43.1 
 
 		 717 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  46.77 
 
 		 727 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  42.53 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 720 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  41.5 
 
 		 710 aa  563  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  44.99 
 
 		 716 aa  563  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 		 717 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 717 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.08 
 
 		 719 aa  559  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  43.04 
 
 		 738 aa  559  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 722 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 		 700 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 735 aa  556  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.74 
 
 		 726 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.36 
 
 		 709 aa  556  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  47.97 
 
 		 714 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  44.05 
 
 		 715 aa  555  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43.24 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  43.68 
 
 		 738 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  44.37 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  45.53 
 
 		 718 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  43.43 
 
 		 708 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  46 
 
 		 754 aa  552  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  46.69 
 
 		 750 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  43.95 
 
 		 722 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  44.71 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  45.19 
 
 		 733 aa  552  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  44.9 
 
 		 701 aa  553  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 711 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  44.74 
 
 		 703 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  41.75 
 
 		 714 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.25 
 
 		 711 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  42.63 
 
 		 704 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  46.71 
 
 		 733 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.72 
 
 		 701 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  46.71 
 
 		 733 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  47 
 
 		 712 aa  549  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  46.25 
 
 		 733 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  46.55 
 
 		 733 aa  546  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  42.47 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  41.69 
 
 		 722 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  44.93 
 
 		 757 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  41.69 
 
 		 720 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  48.94 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  44.19 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  41.69 
 
 		 720 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  47.5 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 766 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 705 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  50.08 
 
 		 658 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  43.12 
 
 		 755 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  42.78 
 
 		 691 aa  543  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  41.94 
 
 		 701 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  43.25 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  47.83 
 
 		 705 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 766 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 705 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.5 
 
 		 755 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  46.31 
 
 		 752 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  43.27 
 
 		 739 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  44.51 
 
 		 779 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.65 
 
 		 723 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.32 
 
 		 758 aa  539  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  43.79 
 
 		 698 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  47.29 
 
 		 739 aa  539  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  42.3 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  41.89 
 
 		 714 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  46.52 
 
 		 704 aa  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  41.89 
 
 		 714 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 		 693 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>