258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4052 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 689 aa  1386    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  59.45 
 
 		 692 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  59.6 
 
 		 692 aa  807    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  62.63 
 
 		 692 aa  844    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  84.62 
 
 		 689 aa  1167    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  97.82 
 
 		 689 aa  1305    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  55.88 
 
 		 691 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  92.45 
 
 		 689 aa  1250    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  52.68 
 
 		 682 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  50.87 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  52.17 
 
 		 684 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  45.42 
 
 		 736 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  44.92 
 
 		 736 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  44.27 
 
 		 726 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  43.48 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  41.49 
 
 		 760 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  41.49 
 
 		 760 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  44.57 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  43.53 
 
 		 697 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  42.98 
 
 		 664 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  42.08 
 
 		 774 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1734  4-alpha-glucanotransferase  42.1 
 
 		 780 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  44.43 
 
 		 743 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1563  4-alpha-glucanotransferase  41.96 
 
 		 740 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  44.43 
 
 		 743 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1335  4-alpha-glucanotransferase  42.1 
 
 		 740 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0817  4-alpha-glucanotransferase  41.96 
 
 		 740 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  43.28 
 
 		 735 aa  429  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0616  4-alpha-glucanotransferase  41.96 
 
 		 740 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.362451  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  44.77 
 
 		 736 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  43.13 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0539  4-alpha-glucanotransferase  41.96 
 
 		 740 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1540  4-alpha-glucanotransferase  41.7 
 
 		 742 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  43.01 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  43.01 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  40.22 
 
 		 630 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.27 
 
 		 1703 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.69 
 
 		 1650 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.44 
 
 		 1646 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.43 
 
 		 1642 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.39 
 
 		 1646 aa  354  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  30.22 
 
 		 732 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.8 
 
 		 1647 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 663 aa  346  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.42 
 
 		 1464 aa  346  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  30.34 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.98 
 
 		 1673 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  31.41 
 
 		 726 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 728 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 726 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31 
 
 		 726 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.48 
 
 		 695 aa  330  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  36.32 
 
 		 717 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  36.76 
 
 		 646 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.89 
 
 		 650 aa  326  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.87 
 
 		 1715 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  35 
 
 		 694 aa  324  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.69 
 
 		 698 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 		 694 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.69 
 
 		 698 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  31.14 
 
 		 694 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.55 
 
 		 698 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.98 
 
 		 694 aa  320  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.23 
 
 		 1633 aa  319  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  31 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.31 
 
 		 731 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 		 694 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.86 
 
 		 694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.59 
 
 		 726 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  37.22 
 
 		 607 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.8 
 
 		 1730 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  30.95 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  31.09 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  31.09 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  33.95 
 
 		 699 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  32.71 
 
 		 696 aa  308  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  30.95 
 
 		 692 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 730 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 		 692 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 		 657 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  31.73 
 
 		 724 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  36.28 
 
 		 619 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 		 708 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  37.26 
 
 		 605 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 		 656 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 707 aa  301  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  32.54 
 
 		 657 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 650 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  29.97 
 
 		 724 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.87 
 
 		 1662 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.21 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 604 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  36.15 
 
 		 630 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  37.4 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  34.2 
 
 		 717 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  32.79 
 
 		 708 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>