259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4231 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
733 aa  1456    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  45.93 
 
 
736 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  45.53 
 
 
736 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 
760 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 
760 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  44.31 
 
 
726 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  46.36 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  42.95 
 
 
692 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 
692 aa  515  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  42.95 
 
 
692 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  45.44 
 
 
689 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  42.86 
 
 
669 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  44.52 
 
 
774 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  44.59 
 
 
689 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  43.54 
 
 
684 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  44.26 
 
 
743 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  43.75 
 
 
743 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  44.57 
 
 
689 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  44.57 
 
 
689 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  42.55 
 
 
697 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  43.42 
 
 
682 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  42.38 
 
 
664 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  42.86 
 
 
736 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  42.47 
 
 
735 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1563  4-alpha-glucanotransferase  43.28 
 
 
740 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  43.22 
 
 
684 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0616  4-alpha-glucanotransferase  43.01 
 
 
740 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.362451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1540  4-alpha-glucanotransferase  42.9 
 
 
742 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0817  4-alpha-glucanotransferase  42.88 
 
 
740 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1734  4-alpha-glucanotransferase  42.88 
 
 
780 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1335  4-alpha-glucanotransferase  43.01 
 
 
740 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0539  4-alpha-glucanotransferase  43.01 
 
 
740 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  42.93 
 
 
740 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  42.93 
 
 
740 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.59 
 
 
1703 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.3 
 
 
1642 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.46 
 
 
1464 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.6 
 
 
1647 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  38.11 
 
 
630 aa  355  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.72 
 
 
1673 aa  354  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.55 
 
 
1646 aa  353  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.82 
 
 
1646 aa  353  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.68 
 
 
1650 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.06 
 
 
726 aa  349  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.15 
 
 
726 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 
726 aa  343  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.06 
 
 
695 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.25 
 
 
726 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  35.7 
 
 
730 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.58 
 
 
1715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 
707 aa  330  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.31 
 
 
732 aa  326  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  34.22 
 
 
694 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  30.77 
 
 
692 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.33 
 
 
694 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  28.12 
 
 
732 aa  323  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.56 
 
 
698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.56 
 
 
698 aa  321  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 
692 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.42 
 
 
1633 aa  320  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  30.77 
 
 
692 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 
692 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  30.77 
 
 
692 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 
698 aa  319  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  34.76 
 
 
717 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.6 
 
 
728 aa  316  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  28.53 
 
 
731 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  29.67 
 
 
694 aa  313  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 
696 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  29.51 
 
 
694 aa  310  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  29.51 
 
 
694 aa  309  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.56 
 
 
1662 aa  310  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  29.67 
 
 
694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.81 
 
 
694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  29.67 
 
 
694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  29.81 
 
 
694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.81 
 
 
694 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  35.98 
 
 
607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  34.64 
 
 
730 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.68 
 
 
1730 aa  306  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  29.39 
 
 
694 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  34.17 
 
 
708 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.28 
 
 
605 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  36.26 
 
 
724 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  35.14 
 
 
717 aa  290  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  29.84 
 
 
699 aa  289  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.51 
 
 
724 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  35.07 
 
 
610 aa  283  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 
663 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  34.13 
 
 
605 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  34.13 
 
 
605 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  31.9 
 
 
646 aa  279  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  32.03 
 
 
656 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  32.8 
 
 
657 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  33.16 
 
 
708 aa  273  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 
657 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 
719 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 
719 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 
719 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  31.28 
 
 
724 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>