260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3481 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  54.13 
 
 		 663 aa  686    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  63.27 
 
 		 650 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  85.54 
 
 		 657 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  69.53 
 
 		 656 aa  891    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 657 aa  1332    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  58.83 
 
 		 646 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  78.12 
 
 		 650 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.33 
 
 		 1464 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  39.56 
 
 		 728 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  35.72 
 
 		 717 aa  359  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  39.66 
 
 		 607 aa  356  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  42.07 
 
 		 605 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  35.15 
 
 		 726 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.22 
 
 		 1703 aa  347  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  34.85 
 
 		 726 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.83 
 
 		 707 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.37 
 
 		 1730 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.78 
 
 		 694 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 699 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  37.35 
 
 		 726 aa  339  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.1 
 
 		 1673 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  34.33 
 
 		 694 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  37.89 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.28 
 
 		 1715 aa  336  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  34.79 
 
 		 692 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  38.83 
 
 		 619 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  34.93 
 
 		 732 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.34 
 
 		 694 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 		 694 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.77 
 
 		 1642 aa  330  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  32.19 
 
 		 694 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.19 
 
 		 694 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  32.19 
 
 		 694 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.19 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  32.19 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.78 
 
 		 1646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  32.19 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  32.19 
 
 		 694 aa  328  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.89 
 
 		 696 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  33.13 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  37.27 
 
 		 724 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.99 
 
 		 1650 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.43 
 
 		 1646 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  35.38 
 
 		 695 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.17 
 
 		 698 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 692 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.17 
 
 		 698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 692 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 692 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 692 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.03 
 
 		 698 aa  320  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.4 
 
 		 1647 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  37.02 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.97 
 
 		 1662 aa  316  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.88 
 
 		 664 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  38.12 
 
 		 630 aa  313  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 732 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  34.41 
 
 		 731 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  34.91 
 
 		 684 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  36.87 
 
 		 736 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  36.81 
 
 		 689 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  38.43 
 
 		 726 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.82 
 
 		 1633 aa  303  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  38.2 
 
 		 689 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  35.47 
 
 		 691 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 		 689 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  37.55 
 
 		 736 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  36.69 
 
 		 808 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 		 743 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  36.87 
 
 		 808 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  36.69 
 
 		 808 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  36.45 
 
 		 808 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 		 724 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  37.13 
 
 		 682 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0938  glycogen operon protein GlgX  38.11 
 
 		 1342 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  33.63 
 
 		 708 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  32.78 
 
 		 669 aa  284  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  34.64 
 
 		 724 aa  282  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 		 801 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 		 801 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 		 730 aa  281  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  34.4 
 
 		 730 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4424  4-alpha-glucanotransferase  36.82 
 
 		 611 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 		 733 aa  280  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 		 796 aa  280  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  33.56 
 
 		 760 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  33.56 
 
 		 760 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  35.78 
 
 		 745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  32.77 
 
 		 684 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  36.41 
 
 		 769 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  35.26 
 
 		 735 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  37.5 
 
 		 630 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 		 718 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>