258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2938 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
664 aa  1295    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  44.49 
 
 
692 aa  512  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  42.9 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  43.42 
 
 
692 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  43.08 
 
 
726 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  43.48 
 
 
736 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  43.36 
 
 
736 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  43.98 
 
 
669 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  43.35 
 
 
689 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  44.33 
 
 
689 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  42.51 
 
 
760 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  42.51 
 
 
760 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  42.59 
 
 
684 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 
733 aa  465  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  44.41 
 
 
736 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  42.78 
 
 
689 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  43.02 
 
 
689 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  43.85 
 
 
697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  43.13 
 
 
691 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  42.29 
 
 
743 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  42.79 
 
 
682 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  42.26 
 
 
743 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  43.11 
 
 
684 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05187  putative 4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase) protein  43.07 
 
 
774 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  47.15 
 
 
735 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  49.55 
 
 
740 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  49.55 
 
 
740 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  48.75 
 
 
729 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0817  4-alpha-glucanotransferase  43.31 
 
 
740 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1335  4-alpha-glucanotransferase  43.31 
 
 
740 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1540  4-alpha-glucanotransferase  43.19 
 
 
742 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1734  4-alpha-glucanotransferase  43.18 
 
 
780 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0616  4-alpha-glucanotransferase  43.45 
 
 
740 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.362451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1563  4-alpha-glucanotransferase  43.18 
 
 
740 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0539  4-alpha-glucanotransferase  43.45 
 
 
740 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03373  4-alpha-glucanotransferase  38.52 
 
 
630 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.12 
 
 
1464 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  38.27 
 
 
607 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  38.28 
 
 
728 aa  321  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  35.29 
 
 
650 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.82 
 
 
1703 aa  319  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  30.49 
 
 
732 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  38.79 
 
 
605 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  38.79 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  38.34 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  35.43 
 
 
646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  35.4 
 
 
708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  36.63 
 
 
733 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  34.42 
 
 
718 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  34.45 
 
 
650 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 
657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  36.02 
 
 
657 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.53 
 
 
732 aa  308  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
724 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.83 
 
 
1647 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  33.8 
 
 
745 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.55 
 
 
1642 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.43 
 
 
1730 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 
663 aa  302  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.17 
 
 
726 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 
796 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  33.71 
 
 
730 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 
730 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.6 
 
 
1650 aa  298  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 
707 aa  297  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.45 
 
 
1646 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  37.85 
 
 
780 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.71 
 
 
695 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 
726 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 
808 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.82 
 
 
801 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  33.51 
 
 
808 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 
801 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 
656 aa  294  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
808 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.04 
 
 
731 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.87 
 
 
1646 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
808 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  34.01 
 
 
717 aa  291  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 
717 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  36.32 
 
 
660 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.29 
 
 
1673 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.43 
 
 
1633 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  31.19 
 
 
761 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.2 
 
 
717 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.18 
 
 
698 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  29.85 
 
 
726 aa  287  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.91 
 
 
1715 aa  287  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.18 
 
 
698 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  34.53 
 
 
708 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  34.43 
 
 
677 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 
698 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  30.26 
 
 
694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.19 
 
 
694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.44 
 
 
696 aa  284  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  35.17 
 
 
619 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  29.82 
 
 
694 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  33.39 
 
 
769 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  29.55 
 
 
694 aa  282  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>