259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2153 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  53.34 
 
 		 717 aa  690    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  55.29 
 
 		 721 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  53.91 
 
 		 733 aa  718    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  58.57 
 
 		 712 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  53.18 
 
 		 708 aa  688    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  50.77 
 
 		 724 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  53.3 
 
 		 718 aa  725    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  60.37 
 
 		 730 aa  836    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  55.86 
 
 		 708 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 717 aa  1446    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  55.01 
 
 		 717 aa  694    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  51.21 
 
 		 730 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  51.94 
 
 		 724 aa  700    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  50.14 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  50.14 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  50.14 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  47.86 
 
 		 702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  46.57 
 
 		 1169 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  47.27 
 
 		 677 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  47.15 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  43.13 
 
 		 721 aa  535  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  41.94 
 
 		 721 aa  531  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  42.99 
 
 		 749 aa  521  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  41.97 
 
 		 745 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  43.09 
 
 		 757 aa  465  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  43.31 
 
 		 780 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  43.7 
 
 		 766 aa  445  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 		 660 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  43.54 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.07 
 
 		 1464 aa  359  9e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  37.9 
 
 		 610 aa  343  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.87 
 
 		 732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.77 
 
 		 1703 aa  334  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.29 
 
 		 1673 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  31.53 
 
 		 694 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.55 
 
 		 1715 aa  324  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  34.52 
 
 		 717 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.91 
 
 		 726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  31.73 
 
 		 694 aa  319  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.2 
 
 		 726 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.3 
 
 		 726 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.59 
 
 		 728 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.44 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  30.26 
 
 		 698 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  30.26 
 
 		 698 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  30.13 
 
 		 698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  31.1 
 
 		 726 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.62 
 
 		 1730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.73 
 
 		 732 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.44 
 
 		 695 aa  300  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  298  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  298  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  29.84 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  29.94 
 
 		 694 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  31.6 
 
 		 696 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  29.94 
 
 		 694 aa  297  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  29.8 
 
 		 694 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  32.61 
 
 		 656 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  33.22 
 
 		 607 aa  291  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  29.93 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.17 
 
 		 1662 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  30.27 
 
 		 692 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  29.2 
 
 		 731 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  29.93 
 
 		 692 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  29.79 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  29.93 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  34.5 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  30.66 
 
 		 699 aa  282  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  33.73 
 
 		 650 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  32.43 
 
 		 604 aa  282  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.39 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.19 
 
 		 1642 aa  281  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  31.58 
 
 		 736 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 		 808 aa  280  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  29.72 
 
 		 745 aa  280  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  35.52 
 
 		 769 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 		 808 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  29.27 
 
 		 724 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 736 aa  279  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.48 
 
 		 684 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 808 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 808 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  30.65 
 
 		 743 aa  276  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.57 
 
 		 646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  32.25 
 
 		 761 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  33.82 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  33.95 
 
 		 605 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 		 801 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  34.04 
 
 		 796 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 		 801 aa  273  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.19 
 
 		 1647 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 		 657 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  31.91 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 726 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1850  4-alpha-glucanotransferase  31.08 
 
 		 690 aa  266  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  29.68 
 
 		 692 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  30.28 
 
 		 760 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>