258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3529 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  53.16 
 
 		 724 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  53.9 
 
 		 708 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  57.56 
 
 		 733 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  54.7 
 
 		 719 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  61.76 
 
 		 708 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  54.7 
 
 		 719 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  55.16 
 
 		 730 aa  745    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  58.43 
 
 		 717 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  54.71 
 
 		 724 aa  723    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  53.77 
 
 		 717 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  57.02 
 
 		 718 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  54.7 
 
 		 719 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  53.62 
 
 		 730 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 712 aa  1398    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  51.67 
 
 		 717 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  49.93 
 
 		 721 aa  618  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  48.95 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  48.19 
 
 		 702 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  47.47 
 
 		 677 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  42.06 
 
 		 749 aa  521  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  45.59 
 
 		 1169 aa  508  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  40.66 
 
 		 721 aa  505  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  40.51 
 
 		 745 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  38.59 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  49.67 
 
 		 780 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  45.43 
 
 		 757 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  45.04 
 
 		 692 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  43.44 
 
 		 660 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  45.81 
 
 		 766 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  42.88 
 
 		 610 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.79 
 
 		 1715 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.39 
 
 		 1464 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.9 
 
 		 694 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.21 
 
 		 1673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  32.08 
 
 		 694 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  31.92 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.08 
 
 		 1703 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.7 
 
 		 1730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  32.27 
 
 		 692 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.27 
 
 		 692 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.66 
 
 		 692 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.42 
 
 		 692 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  34.99 
 
 		 728 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.13 
 
 		 692 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  30.68 
 
 		 698 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  30.68 
 
 		 698 aa  297  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  31.18 
 
 		 694 aa  297  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  30.54 
 
 		 698 aa  296  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 		 707 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  31.2 
 
 		 694 aa  295  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  29.4 
 
 		 731 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.04 
 
 		 694 aa  294  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  31.04 
 
 		 694 aa  294  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.04 
 
 		 694 aa  294  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  30 
 
 		 695 aa  294  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.9 
 
 		 694 aa  293  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.9 
 
 		 694 aa  293  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 694 aa  293  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1850  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 690 aa  291  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  31.18 
 
 		 694 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  28.95 
 
 		 732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  31.2 
 
 		 699 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  30.49 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  31.5 
 
 		 696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.18 
 
 		 732 aa  282  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  29.36 
 
 		 726 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  33.08 
 
 		 761 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.94 
 
 		 1642 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.87 
 
 		 1662 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  35.76 
 
 		 605 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  29.08 
 
 		 726 aa  276  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  29.9 
 
 		 726 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 		 607 aa  275  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.67 
 
 		 1647 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.36 
 
 		 605 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 664 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.48 
 
 		 605 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.71 
 
 		 1646 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.66 
 
 		 1646 aa  269  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.71 
 
 		 1650 aa  268  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  35.07 
 
 		 650 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  31.93 
 
 		 656 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 		 604 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 		 692 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0866  4-alpha-glucanotransferase  33.29 
 
 		 687 aa  260  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  32.92 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 736 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  30.86 
 
 		 736 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  35.1 
 
 		 657 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  32.33 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.45 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.76 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.06 
 
 		 692 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.57 
 
 		 808 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  32.57 
 
 		 808 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  32.56 
 
 		 808 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  29.44 
 
 		 724 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.41 
 
 		 1633 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>