260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1601 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
766 aa  1499    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  43.78 
 
 
730 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  43.86 
 
 
708 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  42.29 
 
 
724 aa  535  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  43.23 
 
 
724 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  44.08 
 
 
708 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  44 
 
 
717 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  43.45 
 
 
719 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  43.45 
 
 
719 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  43.45 
 
 
719 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  45.96 
 
 
718 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  41.41 
 
 
717 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  47.23 
 
 
733 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 
702 aa  485  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  41.23 
 
 
721 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  40.1 
 
 
730 aa  479  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  43.55 
 
 
717 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  43.29 
 
 
780 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  39.15 
 
 
717 aa  436  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  45.95 
 
 
712 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  43.25 
 
 
677 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  34.95 
 
 
721 aa  426  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  36.82 
 
 
745 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  40.58 
 
 
660 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  34.34 
 
 
721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 
749 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  42.01 
 
 
692 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  39.77 
 
 
1169 aa  362  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  43 
 
 
610 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  34.49 
 
 
707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.38 
 
 
717 aa  320  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  29.86 
 
 
732 aa  319  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.14 
 
 
1464 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.57 
 
 
1730 aa  304  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.78 
 
 
1715 aa  300  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  26.44 
 
 
732 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  29.3 
 
 
694 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  30.42 
 
 
694 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.77 
 
 
731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 
735 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.43 
 
 
692 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  29.49 
 
 
698 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  29.49 
 
 
698 aa  279  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  36.39 
 
 
736 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
692 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  29.36 
 
 
698 aa  276  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  31.13 
 
 
696 aa  275  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  30.54 
 
 
692 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  32.9 
 
 
728 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.47 
 
 
1642 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  32.08 
 
 
607 aa  271  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5595  4-alpha-glucanotransferase  34.71 
 
 
743 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  33.64 
 
 
743 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.21 
 
 
1646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1335  4-alpha-glucanotransferase  36.5 
 
 
740 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6494  4-alpha-glucanotransferase  36.5 
 
 
740 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.524038  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.62 
 
 
1646 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.13 
 
 
1662 aa  267  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.13 
 
 
1703 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.02 
 
 
684 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
736 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  30.07 
 
 
692 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  29.93 
 
 
692 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 
733 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  30.11 
 
 
692 aa  264  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  30.25 
 
 
692 aa  264  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  32.32 
 
 
760 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  32.32 
 
 
760 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.66 
 
 
1650 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  29.79 
 
 
692 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6083  4-alpha-glucanotransferase  40.82 
 
 
729 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.84 
 
 
1647 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  31.16 
 
 
689 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  28.87 
 
 
699 aa  259  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  28.97 
 
 
695 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 
682 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  37.32 
 
 
646 aa  258  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.29 
 
 
1633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.38 
 
 
1673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  31.16 
 
 
684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.8 
 
 
736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  27.95 
 
 
694 aa  255  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  27.89 
 
 
694 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  33.84 
 
 
650 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  27.89 
 
 
694 aa  252  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  28.43 
 
 
726 aa  251  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  27.76 
 
 
694 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  27.76 
 
 
694 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  28.28 
 
 
726 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.28 
 
 
726 aa  251  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  27.89 
 
 
694 aa  250  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  27.63 
 
 
694 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  27.63 
 
 
694 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.72 
 
 
664 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  27.82 
 
 
726 aa  248  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  28.55 
 
 
694 aa  247  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  31.99 
 
 
604 aa  247  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  28.66 
 
 
761 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.6 
 
 
691 aa  246  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 
689 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>