260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0996 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
660 aa  1284    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  53.25 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  45.04 
 
 
708 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  48.03 
 
 
780 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  42.98 
 
 
730 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  46.19 
 
 
717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  47.44 
 
 
724 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  52.34 
 
 
757 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  43.1 
 
 
724 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  44.15 
 
 
719 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  44.15 
 
 
719 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  44.15 
 
 
719 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  44.25 
 
 
677 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  40.62 
 
 
730 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  41.36 
 
 
717 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  42.22 
 
 
708 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  42.82 
 
 
712 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  41.11 
 
 
733 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  42.92 
 
 
702 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  41.06 
 
 
717 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  46.69 
 
 
717 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  40.76 
 
 
718 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  37.37 
 
 
721 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  38.93 
 
 
766 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  37.22 
 
 
749 aa  398  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
745 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  40.03 
 
 
721 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 
721 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  41.12 
 
 
610 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  39.11 
 
 
1169 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.5 
 
 
1673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.5 
 
 
1730 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.74 
 
 
1715 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.84 
 
 
1464 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.7 
 
 
1703 aa  309  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  33.48 
 
 
698 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  33.48 
 
 
698 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  34.64 
 
 
707 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  36.02 
 
 
694 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.47 
 
 
1642 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.47 
 
 
1647 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  39.25 
 
 
605 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 
717 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.86 
 
 
1662 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  35.76 
 
 
696 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  36.47 
 
 
607 aa  293  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  35.85 
 
 
694 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  31.47 
 
 
695 aa  290  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  34.71 
 
 
692 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 
692 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  31.94 
 
 
692 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.42 
 
 
692 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 
692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 
692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  36.12 
 
 
691 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  31.93 
 
 
761 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.36 
 
 
664 aa  280  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 
692 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.66 
 
 
732 aa  279  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 
726 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.95 
 
 
694 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.66 
 
 
694 aa  278  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.34 
 
 
726 aa  278  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  37.82 
 
 
605 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 
694 aa  277  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 
694 aa  277  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  36.06 
 
 
728 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 
694 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  32.43 
 
 
724 aa  277  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 
694 aa  277  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.66 
 
 
694 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.8 
 
 
694 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  36.25 
 
 
692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.66 
 
 
694 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  32.79 
 
 
731 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  31.34 
 
 
726 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.27 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
732 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 
604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  33.7 
 
 
726 aa  273  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.16 
 
 
682 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.84 
 
 
1646 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.52 
 
 
808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.46 
 
 
808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 
736 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  32.48 
 
 
769 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
619 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  33.59 
 
 
801 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  33.4 
 
 
808 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.91 
 
 
684 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  33.21 
 
 
808 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  33.78 
 
 
801 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  34.99 
 
 
669 aa  267  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.4 
 
 
1646 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.12 
 
 
1650 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.9 
 
 
736 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  34.07 
 
 
689 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  33.4 
 
 
796 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 
726 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>