257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2454 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2454  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 743 aa  1503    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  39.8 
 
 		 761 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1247  4-alpha-glucanotransferase  39.49 
 
 		 745 aa  512  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1493  4-alpha-glucanotransferase  37.86 
 
 		 769 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1320  4-alpha-glucanotransferase  44.77 
 
 		 808 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3029  4-alpha-glucanotransferase  44.25 
 
 		 808 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  44.25 
 
 		 808 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  44.25 
 
 		 808 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2837  4-alpha-glucanotransferase  42.91 
 
 		 801 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2935  4-alpha-glucanotransferase  42.91 
 
 		 801 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2759  4-alpha-glucanotransferase  42.56 
 
 		 796 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1167  4-alpha-glucanotransferase  37.99 
 
 		 745 aa  438  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  34.36 
 
 		 724 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.18 
 
 		 732 aa  352  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 		 694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  36.9 
 
 		 694 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 		 707 aa  331  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  33.99 
 
 		 726 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  33.03 
 
 		 726 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  31.78 
 
 		 717 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  33.42 
 
 		 726 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  33.02 
 
 		 698 aa  317  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  33.02 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  33.02 
 
 		 698 aa  316  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.9 
 
 		 726 aa  315  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 696 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  32.85 
 
 		 699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.98 
 
 		 731 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  35.75 
 
 		 694 aa  300  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.75 
 
 		 694 aa  299  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  35.58 
 
 		 694 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  35.21 
 
 		 694 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  35.41 
 
 		 694 aa  298  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  35.41 
 
 		 694 aa  298  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  35.23 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  35.23 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  35.01 
 
 		 694 aa  297  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  32.12 
 
 		 692 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  29.68 
 
 		 732 aa  296  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  32.23 
 
 		 692 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 		 692 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  31.72 
 
 		 692 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  31.99 
 
 		 692 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  31.99 
 
 		 733 aa  292  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  35.79 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5566  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.62 
 
 		 1464 aa  283  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.43 
 
 		 1703 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 695 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  29.56 
 
 		 717 aa  280  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.78 
 
 		 605 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.42 
 
 		 1662 aa  277  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  30.69 
 
 		 717 aa  277  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.95 
 
 		 605 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  29.99 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  30.39 
 
 		 718 aa  271  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  32.63 
 
 		 619 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  31.04 
 
 		 708 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.13 
 
 		 1730 aa  263  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  33.58 
 
 		 630 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  31.21 
 
 		 728 aa  259  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  29.5 
 
 		 724 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  31.87 
 
 		 1673 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 		 717 aa  253  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  31.9 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  32.54 
 
 		 721 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.4 
 
 		 1642 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  30.31 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  28.52 
 
 		 1715 aa  248  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  32.84 
 
 		 726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  28.59 
 
 		 721 aa  246  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  31.64 
 
 		 717 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  32.36 
 
 		 677 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  32.25 
 
 		 664 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.44 
 
 		 1647 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  30.12 
 
 		 692 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  27.9 
 
 		 721 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 		 736 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  31.2 
 
 		 724 aa  242  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  28.71 
 
 		 1169 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  28.2 
 
 		 745 aa  240  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  29.44 
 
 		 749 aa  239  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 		 607 aa  239  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 719 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 719 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  30.9 
 
 		 719 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  29.98 
 
 		 708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  29.68 
 
 		 1633 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  30.12 
 
 		 1646 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 702 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  29.71 
 
 		 1646 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  29.92 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  32.4 
 
 		 692 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1885  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 657 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  30.58 
 
 		 650 aa  230  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 663 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  31.82 
 
 		 736 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 		 692 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  30.25 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>