More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3199 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  68.81 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  67.86 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  66.67 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  70.64 
 
 		 110 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  65.71 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  63.96 
 
 		 115 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  69.72 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  69.72 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  64.22 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  63.06 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  64.22 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  65.45 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  65.45 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  65.14 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  64.55 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  62.16 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  63.21 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  61.82 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  63.3 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  58.18 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  62.62 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  58.18 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  66.06 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  62.86 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  59.29 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  59.46 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  51.35 
 
 		 111 aa  126  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  52.25 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  52.29 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  57.01 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  54.21 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  63.44 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  52.68 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  52.68 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  54.95 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  54.95 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  51.85 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  52.78 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  49.55 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  54.05 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  50.93 
 
 		 111 aa  110  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  52.83 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  53.7 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  46.43 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  48.62 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  56.18 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  57.29 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  55.88 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 693 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 680 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 710 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 682 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  44.04 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  44.04 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 634 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 680 aa  80.1  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 629 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 629 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 634 aa  76.6  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 688 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 645 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 705 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 650 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 653 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.3 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 653 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 690 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 711 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 662 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 632 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 669 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 691 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 664 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.04 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 671 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  35.85 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>