More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2644 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  77.06 
 
 		 110 aa  180  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  72.41 
 
 		 116 aa  177  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  75.23 
 
 		 117 aa  174  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  72.48 
 
 		 113 aa  168  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  71.56 
 
 		 110 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  71.56 
 
 		 110 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  70.64 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  69.37 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  70.37 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  67.57 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  67.86 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  68.47 
 
 		 115 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  67.27 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  67.27 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  67.27 
 
 		 115 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  66.36 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  64.22 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  62.16 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  62.26 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  66.67 
 
 		 110 aa  141  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  64.22 
 
 		 116 aa  141  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  64.22 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  59.46 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  59.63 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  60.36 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  61.61 
 
 		 113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  61.54 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  59.09 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  62.96 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  57.01 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  57.01 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  55.56 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  56.76 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  56.76 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  54.21 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  53.15 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  53.77 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  51.4 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  53.15 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  55.56 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  48.62 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  67.06 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  48.62 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  45.05 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  50.93 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  50.45 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  50.98 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  48.7 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  47.75 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 680 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  42.48 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 682 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  43.36 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 705 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 680 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 693 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 654 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 711 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 672 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 688 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 692 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 704 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 670 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 691 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 702 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 688 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 698 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 690 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 678 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 673 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 702 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 710 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 690 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 648 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 686 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 689 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.84 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 676 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 702 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 653 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 689 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>