294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5117 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  74.8 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  73.98 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  73.17 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  69.92 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  65.49 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  66.67 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  66.97 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  62.07 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  61.4 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  62.16 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  61.61 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  66.07 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  65.14 
 
 		 110 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  62.5 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  65.18 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  62.5 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  62.39 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  64.49 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  63.3 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  63.3 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  64.29 
 
 		 113 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  63.89 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  58.26 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  58.18 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  58.56 
 
 		 112 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  60.87 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  56.76 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  57.8 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  54.55 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  56.48 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  59.81 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  53.39 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  53.7 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  53.7 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  50.47 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  53.21 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  53.21 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  51.4 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  49.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  51.89 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  51.4 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  49.12 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  46.79 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  49.53 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  49.54 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  49.53 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  45.37 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  52.81 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  49.07 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  48.15 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  47.12 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  41.35 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  44.44 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  45.28 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 685 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 670 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 669 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  41.28 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 693 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 680 aa  70.5  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 682 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 690 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 680 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 648 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  37.17 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 705 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 711 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1132  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 696 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 640 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 678 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 678 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 657 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 688 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 686 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 642 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 678 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 702 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 702 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 698 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 628 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 692 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 692 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 642 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 654 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>