258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0941 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  61.22 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  61.22 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  70.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  60.22 
 
 		 113 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  52.53 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  54.9 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  53.47 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  55.91 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  57.3 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  57.84 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  48.7 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  58.06 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  57.89 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  51.82 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  59.3 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  50.46 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  58.7 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  67.06 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  54.08 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  55.1 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  56.67 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  57.45 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  52.04 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  56.67 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  51.65 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  53.06 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  51.85 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.06 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  53.06 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  55.81 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  53.06 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  52.81 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  56.18 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  54.22 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  51.65 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  55.81 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  48.48 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  54.08 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  56.82 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  55.32 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  55.42 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  55.42 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  50.56 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  55.42 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  55.32 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.42 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  54.22 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  55.42 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  53.57 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  52.38 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  53.01 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  54.22 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  49.44 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  44.9 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  43.52 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  54.26 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  46.74 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  43.04 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  45.83 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  45.56 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  46.24 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  40.86 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  40.96 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  36.47 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 634 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  34.09 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 648 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  35.23 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 689 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 702 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 690 aa  53.9  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 689 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 689 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 650 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 688 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 689 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 672 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 676 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 660 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 686 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 690 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 680 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 704 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 702 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 634 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>