281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1642 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  95.65 
 
 
115 aa  228  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  94.78 
 
 
115 aa  225  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  73.04 
 
 
115 aa  174  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  73.87 
 
 
113 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  71.17 
 
 
113 aa  166  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  71.56 
 
 
113 aa  166  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  71.17 
 
 
113 aa  166  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  71.82 
 
 
117 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  70.37 
 
 
119 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  70.64 
 
 
112 aa  158  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  66.96 
 
 
123 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  71.15 
 
 
121 aa  154  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  66.97 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  66.97 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  66.06 
 
 
110 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  61.82 
 
 
111 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  63.72 
 
 
116 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  63.89 
 
 
112 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  64.6 
 
 
145 aa  147  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  64.66 
 
 
116 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  64.6 
 
 
123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  63.72 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  63.64 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  61.47 
 
 
112 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 
111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  62.5 
 
 
123 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 
111 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  62.96 
 
 
119 aa  141  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  67.33 
 
 
110 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  64.55 
 
 
112 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  57.8 
 
 
112 aa  137  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  59.26 
 
 
111 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 
112 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 
119 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 
121 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  64.42 
 
 
110 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  56.76 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  57.66 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  56.36 
 
 
111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  51.82 
 
 
111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  58.04 
 
 
115 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  52.78 
 
 
111 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  50.91 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  51.38 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  57.41 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  57.41 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 
111 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  55.96 
 
 
117 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  49.54 
 
 
111 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  56.07 
 
 
109 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  56.07 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  55.14 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  55.14 
 
 
109 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  55.14 
 
 
109 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  55.14 
 
 
109 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  55.14 
 
 
109 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  56.07 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  54.21 
 
 
109 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  53.85 
 
 
116 aa  114  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  53.27 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  52.04 
 
 
128 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  51.92 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 
109 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  42.73 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  47.06 
 
 
109 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  46.15 
 
 
111 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  50.63 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
682 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
648 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
680 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
654 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
657 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
653 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  40.38 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
654 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
705 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
691 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
711 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
659 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
690 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
670 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
640 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
693 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
672 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
663 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
660 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
642 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
664 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  30.91 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
648 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
669 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>