More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0025 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  74.81 
 
 		 654 aa  1038    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 653 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 654 aa  710    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1379    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 648 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 632 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 		 645 aa  727    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 645 aa  724    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 653 aa  660    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 651 aa  634  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 655 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 660 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 650 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 645 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 650 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 659 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 656 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 660 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 657 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 657 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 660 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 660 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 660 aa  608  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 660 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 660 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 660 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 675 aa  602  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 647 aa  601  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 675 aa  591  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 702 aa  585  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 681 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 645 aa  534  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 518 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 634 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 650 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 651 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 647 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 634 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 638 aa  500  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 642 aa  495  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 629 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 638 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 628 aa  489  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 509 aa  485  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 636 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 642 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 640 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 506 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 628 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 648 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 628 aa  458  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 642 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 663 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 624 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 657 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.34 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 670 aa  432  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 530 aa  425  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl036  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 670 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 515 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 539 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 523 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>