More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7066 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 680 aa  844    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 688 aa  833    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 699 aa  730    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 702 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 693 aa  1443    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 682 aa  831    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 690 aa  807    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 689 aa  838    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 691 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 711 aa  833    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  57.7 
 
 		 557 aa  690    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 		 705 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 702 aa  622  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 702 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 700 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 703 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 663 aa  512  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 663 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 663 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 663 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 734 aa  492  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 672 aa  486  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 669 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 690 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 664 aa  428  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 673 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 684 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 592 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 577 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 710 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 694 aa  399  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 680 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 677 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 674 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 734 aa  395  1e-108  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 680 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 678 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 677 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  32.19 
 
 		 677 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 678 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 676 aa  389  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 673 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 676 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 688 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 676 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 793 aa  382  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 683 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19050  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 678 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.153863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 675 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 686 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 614 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 679 aa  379  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 676 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>