More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2630 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 577 aa  1189    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 699 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 690 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 682 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 704 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 702 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 680 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 705 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  39.51 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 600 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 592 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 703 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 734 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 702 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 702 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 702 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 550 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 606 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 600 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 595 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  39.14 
 
 		 593 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 614 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 663 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 663 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 605 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 793 aa  390  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 663 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 663 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 672 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 572 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1747  methionyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  35.62 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 596 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2349  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 572 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2045  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 572 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 595 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 617 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2707  methionyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  35.89 
 
 		 757 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 544 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 551 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 544 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 544 aa  362  9e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 582 aa  359  6e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 544 aa  359  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 544 aa  359  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 544 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 567 aa  352  8e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 734 aa  350  4e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 673 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 664 aa  347  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 568 aa  346  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 573 aa  346  8e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 669 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 710 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 677 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 690 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 675 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 677 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 677 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 677 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  34.51 
 
 		 677 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 677 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 677 aa  331  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 677 aa  331  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>