More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2825 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 663 aa  931    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 673 aa  855    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 		 662 aa  971    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 664 aa  921    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 710 aa  800    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 690 aa  1447    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 684 aa  785    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 669 aa  817    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 717 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 705 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 714 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 697 aa  566  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 663 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 663 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 672 aa  502  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 734 aa  456  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 705 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 702 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 693 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 702 aa  439  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 700 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 682 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 711 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 702 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 704 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 691 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 680 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 703 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 689 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 702 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 678 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 731 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 676 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 676 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 683 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 686 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 676 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 690 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 698 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 683 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 678 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 709 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 688 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 679 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 716 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 685 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 688 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 720 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 718 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 718 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 694 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 674 aa  362  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 686 aa  362  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 793 aa  360  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 		 676 aa  359  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 722 aa  359  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 694 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 682 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2554  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 675 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1137  methionyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 710 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 676 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 675 aa  357  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 675 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 544 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3197  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 675 aa  356  8.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000166166  decreased coverage  0.00110356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 688 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01790  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 694 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 677 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 677 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>