More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2601 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
710 aa  659    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 
708 aa  938    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  68.78 
 
 
697 aa  1007    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
684 aa  651    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
717 aa  1464    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  69.96 
 
 
714 aa  1026    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  87.43 
 
 
705 aa  1264    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
669 aa  630  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
662 aa  627  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
664 aa  620  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
690 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
673 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
663 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
672 aa  457  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
663 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
663 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
663 aa  438  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
699 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
711 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
688 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
675 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
680 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
680 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
691 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
704 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
698 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
734 aa  388  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
689 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
690 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
689 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
688 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
679 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
675 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
682 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
702 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 
700 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
692 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 
683 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
689 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
678 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
675 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 
679 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
676 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
689 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
689 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
702 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
689 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
676 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
676 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
693 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
678 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
681 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
673 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 
676 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
713 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
674 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
705 aa  372  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
680 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
702 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
677 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
692 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
692 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
700 aa  362  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1678  methionyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 
702 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
681 aa  360  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
686 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
683 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
680 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
689 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
677 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1753  methionyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
685 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
700 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
722 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
691 aa  356  8.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
681 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
694 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
678 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
540 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
676 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
678 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
678 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
702 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
677 aa  353  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
703 aa  353  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
720 aa  353  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
731 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
676 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
677 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
677 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
716 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  30.48 
 
 
677 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
677 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
725 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>