More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1328 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 
672 aa  931    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  97.44 
 
 
663 aa  1345    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
663 aa  1372    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  97.13 
 
 
663 aa  1340    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  78.43 
 
 
663 aa  1100    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
664 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
690 aa  525  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
669 aa  525  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
673 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 
663 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
710 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
662 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
693 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
684 aa  489  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
699 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
690 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
680 aa  477  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
682 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
688 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
734 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
689 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
711 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
717 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
691 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
705 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
702 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
705 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
702 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
714 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
700 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
702 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
702 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
703 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
704 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
708 aa  418  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
697 aa  415  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
577 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
680 aa  389  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  37 
 
 
557 aa  386  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
540 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
691 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
734 aa  382  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 
553 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
679 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
553 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
692 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 
673 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
680 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
686 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
676 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
675 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
553 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
689 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
688 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
675 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
683 aa  375  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
676 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
676 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
689 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 
689 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
676 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
544 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
544 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
683 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
689 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 
689 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
698 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
686 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
674 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
692 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
692 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
716 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
718 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
731 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
718 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
720 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
679 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
722 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
720 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
544 aa  364  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
544 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
688 aa  364  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
544 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
544 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
720 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
709 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
678 aa  362  9e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
710 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
688 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
544 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
544 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
685 aa  360  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
661 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
565 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
678 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
670 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
678 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>