More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1277 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 
680 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  61.79 
 
 
682 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
711 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
690 aa  732    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
691 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  66.12 
 
 
689 aa  796    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1164    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 
702 aa  717    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 
688 aa  738    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 
693 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
699 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
700 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
704 aa  527  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
702 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
703 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
702 aa  512  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
705 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
702 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
734 aa  502  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
592 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
606 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
553 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
553 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
574 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
565 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
540 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
553 aa  432  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
605 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
600 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
597 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
605 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  37.77 
 
 
593 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
600 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
603 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
600 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
595 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
611 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
614 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 
596 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
600 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
544 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
617 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
544 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
599 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
544 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
544 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
544 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
565 aa  396  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
544 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
544 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
544 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
595 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  36.26 
 
 
625 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
582 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
663 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
544 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
663 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
663 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 
663 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
573 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
568 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
567 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
550 aa  381  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2349  methionyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
572 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
572 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
572 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
557 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
570 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
565 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  34.23 
 
 
757 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
570 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
672 aa  369  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2707  methionyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
572 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
570 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2045  methionyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
572 aa  359  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1747  methionyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
569 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733283  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
673 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
663 aa  355  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
572 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
662 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
793 aa  350  5e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
690 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  35.45 
 
 
658 aa  346  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
734 aa  343  5e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
684 aa  343  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
692 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
692 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
664 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
710 aa  340  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
717 aa  335  9e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
673 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
669 aa  334  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
681 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>